[发明专利]一种用于转座酶片段化的试剂及其应用在审
申请号: | 201910940371.0 | 申请日: | 2019-09-30 |
公开(公告)号: | CN110564705A | 公开(公告)日: | 2019-12-13 |
发明(设计)人: | 张惠丹;戴敬;杨晟;黎晗 | 申请(专利权)人: | 苏州璞瑞卓越生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N9/12 | 分类号: | C12N9/12;C40B50/06;C12Q1/6806 |
代理公司: | 32256 南京利丰知识产权代理事务所(特殊普通合伙) | 代理人: | 王茹;王锋 |
地址: | 215000 江苏省苏州市工*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 反应缓冲液 片段化 试剂及试剂 独立包装 转座 集合 使用灵活性 体系稳定性 反向引物 核酸文库 接头连接 末端修复 实际需求 正向引物 试剂盒 转座酶 测序 构建 建库 商品化 | ||
1.一种用于转座酶片段化的试剂,其特征在于包括独立包装的如下组件:Tn5转座酶、第一接头、第二接头以及转座反应缓冲液,所述Tn5转座酶的序列如SEQ ID NO.1所示,所述第一接头的序列如SEQ ID NO.2~3所示,所述第二接头的序列如SEQ ID NO.4~5所示。
2.根据权利要求1所述试剂,其特征在于:所述第一接头包括第一单链DNA和第二单链DNA,所述第一单链DNA包括依次连接的捕获标签、指定的单链DNA和所述转座酶的识别序列,所述第二单链DNA为所述识别序列的互补序列;所述第二接头包括所述识别序列以及所述识别序列的互补序列。
3.根据权利要求1所述试剂,其特征在于还包括独立包装的正向引物的集合、反向引物的集合、扩增酶、扩增反应缓冲液。
4.根据权利要求1所述试剂,其特征在于还包括独立包装的片段化反应缓冲液、终止溶液中的任意一种或多种。
5.一种试剂盒,其特征在于包括权利要求1-3中任一项所述试剂。
6.根据权利要求5所述试剂盒,其特征在于还包括独立包装的DNA磁珠。
7.一种片段化核酸文库的构建方法,其特征在于包括:
将Tn5转座酶、第一接头、第二接头于转座反应缓冲液中混合,并在室温下孵育30~120min,获得转座子复合物,之后进行纯化处理,其中所述Tn5转座酶的序列如SEQ ID NO.1所示,所述第一接头的序列如SEQ ID NO.2~3所示,所述第二接头的序列如SEQ ID NO.4~5所示;
将纯化后的转座子复合物、人类基因组DNA与片段化反应缓冲液、超纯水混合,并在50~60℃孵育3~15min,之后加入终止溶液50~60℃孵育3~7min终止反应,获得片段化产物;
之后将片段化产物与正向引物的集合、反向引物的集合、扩增酶、扩增反应缓冲液混合,并进行PCR反应,获得富集的DNA片段。
8.根据权利要求7所述构建方法,其特征在于具体包括:向所述片段化反应液内加入DNA磁珠并充分混匀,室温孵育5~20min,之后以100~300rpm的转速离心5~20s,之后分离出DNA磁珠,先后以乙醇、超纯水清洗,完成所述纯化处理。
9.根据权利要求7所述构建方法,其特征在于还包括:从富集的DNA片段中分选出指定长度的DNA片段,获得片段化核酸文库。
10.根据权利要求7所述构建方法,其特征在于还包括:对所获片段化核酸文库的纯度进行检测。
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