[发明专利]一种DNA编码化合物库的液相色谱纯化方法有效

专利信息
申请号: 201910943404.7 申请日: 2019-09-30
公开(公告)号: CN112575389B 公开(公告)日: 2023-09-19
发明(设计)人: 蔡玫烜;曾善超;张星河;何文彬;万金桥;李进 申请(专利权)人: 成都先导药物开发股份有限公司
主分类号: C40B50/08 分类号: C40B50/08;C40B40/08;G01N30/02;G01N30/14;G01N30/34;G01N30/74
代理公司: 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 代理人: 李高峡;张娟
地址: 610000 四川省成都市双*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 dna 编码 化合物 色谱 纯化 方法
【说明书】:

本发明提供了一种用于DNA编码化合物库纯化的液相色谱纯化方法,所述方法为:取DNA编码化合物或其中间体,利用液相色谱柱进行洗脱,即可;其中,洗脱采用的流动相中,A相含有水、二异丙基乙胺、六氟异丙醇,B相含有甲醇。实验结果表明,本发明提供的液相纯化方法可以有效去除DNA编码化合物库合成过程中引入的单段DNA片段,还能够有效去除多个单段DNA片段相连生成的DNA片段杂质,能够显著提升DNA编码化合物库的最终产物纯度,并显著减少DNA片段的用量,降低生产成本,具有非常好的应用前景。

技术领域

本发明涉及一种DNA编码化合物库的液相色谱纯化方法。

背景技术

在新药研发领域,针对生物靶标的高通量筛选是快速获得先导化合物的主要手段之一。然而,基于单个分子的传统高通量筛选所需时间长、设备投入巨大、库化合物数量有限(数百万),且化合物库的建成需要数十年的积累,限制了先导化合物的发现效率与可能性。近年来出现的DNA编码化合物库技术(WO2005058479、WO2018166532、CN103882532),结合了组合化学和分子生物学技术,在分子水平上将每个化合物加上一个DNA标签,能在极短的时间内合成高达亿级的化合物库。而且化合物能够通过基因测序的方法进行识别,大幅度地增加了化合物库的大小和合成效率,成为下一代化合物库筛选技术的趋势,并开始在制药行业广泛应用,产生了诸多积极的效果(Accounts of Chemical Research,2014,47,1247-1255)。

DNA编码化合物库(DEL)的构建利用组合化学的“组合-拆分”策略,可快速得到数量巨大的化合物库,并且化合物中的每一维结构信息都可以由唯一的DNA片段进行标记。在DNA编码化合物库的构建过程中,每一维度都需要加入过量的DNA片段进行反应以保证化合物被正确标记。然而过量的DNA片段会继续与下一维度的DNA片段发生反应,导致后续的磁珠纯化不完全,从而影响最终DNA编码化合物库的纯度。另外由于DNA编码化合物库的成本大部分来自于DNA片段,过量的DNA片段会增加下一维度DNA片段的使用量,从而导致构建成本的大幅增加。

中国专利201610229301.0公开了一种固相合成DNA编码化合物库的方法,该专利对固相合成DNA编码化合物生产过程中的粗产物用蒸馏水和0.1M TEAA(醋酸三乙胺)缓冲溶液洗涤,进行纯化。但是,该纯化方法仅用于固相合成的纯化,并且不能除去未反应的DNA片段。目前液相合成DNA编码化合物库常用的纯化方法(如TEAA体系)并不能很好地除去未反应的DNA片段,因此,开发一种新的能够有效除去过量DNA片段的纯化方法,能大幅节约构建化合物库的成本,并且提高DNA编码化合物库的纯度,可以极大地提高DNA编码化合物库的应用价值。

发明内容

本发明的目的在于提供一种DNA编码化合物库的液相色谱纯化方法。

本发明提供了一种用于DNA编码化合物库纯化的液相色谱纯化方法,取DNA编码化合物或其中间体,利用液相色谱柱进行洗脱,即可;其中,洗脱采用的流动相中,A相含有水、二异丙基乙胺、六氟异丙醇,B相含有甲醇。

进一步地,所述流动相中,B相的体积百分数为1%~90%。

进一步地,所述A相由水、二异丙基乙胺和六氟异丙醇组成。

进一步地,所述A相中,异丙基乙胺的体积百分数为0.01~1%,六氟异丙醇的体积百分数为0.5%~10%,其余为水;

优选地,所述A相中,异丙基乙胺的体积百分数为0.05~0.5%,六氟异丙醇的体积百分数为1%~5%,其余为水;

更优选地,所述A相中,异丙基乙胺的体积百分数为0.15%,六氟异丙醇的体积百分数为2.5%,其余为水。

进一步地,所述B相为甲醇。

进一步地,所述方法中,洗脱条件如下:

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