[发明专利]一种快速定量检测RNA加帽效率的方法在审
申请号: | 201910951836.2 | 申请日: | 2019-10-09 |
公开(公告)号: | CN112626177A | 公开(公告)日: | 2021-04-09 |
发明(设计)人: | 朱斌;成锐;夏恒;黄锋涛;吴慧;陆雪玲;闫艳;余兵兵;王雄略;蒋怡心 | 申请(专利权)人: | 华中科技大学;深圳华中科技大学研究院 |
主分类号: | C12Q1/6809 | 分类号: | C12Q1/6809 |
代理公司: | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人: | 徐瑛 |
地址: | 430075 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 定量 检测 rna 效率 方法 | ||
1.一种快速定量检测RNA加帽效率的方法,其特征在于,由以下步骤组成:
S1.体外转录合成未加帽的RNA,并除去模板DNA;
S2.对步骤S1得到的所述RNA进行加帽处理;
S3.对加帽处理后的RNA进行单磷酸化处理:先利用碱性磷酸酶进行去磷酸化,RNA纯化后再利用多聚核苷酸激酶在RNA的5’端加上单磷酸;
S4.用单磷酸酶处理步骤S3中所述的进行单磷酸化处理后的RNA,并设置不用单磷酸酶处理的对照组;
S5.跑胶检测,定量测定上述用单磷酸酶处理的RNA的条带亮度(记为n)以及所述对照组的RNA的条带亮度(记为N),计算出RNA的加帽效率为:(n/N)×100%。
2.根据权利要求1所述的一种快速定量检测RNA加帽效率的方法,其特征在于,步骤S1-S3后均需进行RNA纯化。
3.根据权利要求1所述的一种快速定量检测RNA加帽效率的方法,其特征在于,步骤S1具体包括:以纯化后的线性DNA作为模板,加入RNA聚合酶起始RNA的体外转录,得到未加帽的RNA,然后用DNA酶消化除去模板DNA。
4.根据权利要求1所述的一种快速定量检测RNA加帽效率的方法,其特征在于,步骤S2中所述加帽处理的方法为:利用加帽酶对RNA进行体外加帽。
5.根据权利要求4所述的一种快速定量检测RNA加帽效率的方法,其特征在于,所述加帽酶为牛痘病毒加帽酶。
6.根据权利要求1所述的一种快速定量检测RNA加帽效率的方法,其特征在于,步骤S2中所述加帽处理的方法为:在步骤S1所述的体外转录过程中,同时加入抗-反向帽类似物-ARCA进行共转录。
7.根据权利要求1所述的一种快速定量检测RNA加帽效率的方法,其特征在于,步骤S3中所述碱性磷酸酶为小牛肠碱性磷酸酶,所述多聚核苷酸激酶为T4多聚核苷酸激酶。
8.根据权利要求1所述的一种快速定量检测RNA加帽效率的方法,其特征在于,步骤S4中所述单磷酸酶为XRN-1。
9.根据权利要求1所述的一种快速定量检测RNA加帽效率的方法,其特征在于,步骤S5中利用ImageJ软件定量测定所述条带亮度。
10.一种权利要求1所述的一种快速定量检测RNA加帽效率的方法在RNA生产期间及RNA作为治疗产品的质量控制中的应用。
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