[发明专利]用于显微图像全景拼接系统及方法有效
申请号: | 201910963671.0 | 申请日: | 2019-10-11 |
公开(公告)号: | CN110807732B | 公开(公告)日: | 2023-08-29 |
发明(设计)人: | 孙小蓉;庞宝川;肖笛 | 申请(专利权)人: | 武汉兰丁智能医学股份有限公司 |
主分类号: | G06T3/40 | 分类号: | G06T3/40;G06T5/50 |
代理公司: | 武汉维盾知识产权代理事务所(普通合伙) 42244 | 代理人: | 彭永念 |
地址: | 430000 湖北省武汉市东湖新技术开发区*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 显微 图像 全景 拼接 系统 方法 | ||
1.一种用于显微图像全景拼接系统,其特征是它包括:视野子块匹配模块、视野位置拟合模块和块提取模块;
视野子块匹配模块用于识别各个图像之间的重叠区域判断子图像之间的相邻位置关系,使显微扫描装置获取的各个子图像自动按照图像的拼合顺序排列;
视野位置拟合模块用于根据各个子图像之间的重叠区域微调位置,以使细胞位置准确拼合;
块提取模块用于自动提取出拼合完整的图像;
对重叠位置的像素值进行分析,通过视野子块匹配模块使图像自动匹配相应的位置,根据相邻视野中的相匹配的特征点计算出平台偏移到像素偏移的二维变换矩阵的初始值,得到拼接参数;具体的是确定各个视野子块相对于其他视野子块的相邻位置;
切割相邻视野的公共部分,分为多个小块,采用模板匹配,寻找公共重合区域,选取匹配阈值大于0.9的匹配块;
算出所有视野的模板匹配的相互关系;
位置匹配成功后,通过视野位置拟合智能算法使细胞位置准确拼合;通过模板匹配之后,可以得到每个视野像素的大致位置,通过初始的拼接参数和平台的最大位移偏差,计算出最大的像素偏差;
使用最大像素偏差,过滤每个视野与相邻视野匹配关系的点,去掉偏差大于最大像素偏差的点,通过筛选后的点,再重新计算拼接参数,使用最新的拼接参数,重新计算视野的像素位置,通过不断地迭代筛选和重新计算,不断更新和完善视野的图片位置。
2.根据权利要求1所述的一种用于显微图像全景拼接系统,其特征是:视野子块匹配模块的运行过程为:
Sa01、输入,结果集初始化M;
Sa02、设置当前视野i为第一个视野;
Sa03、求当前视野i的所有相邻视野集合J;
Sa04、设置当前相邻视野j为J中的第一个视野;
Sa05、求视野i和视野j的可能重叠区域Ri和Rj;
Sa06、将模板区域Ri栅格化为模板子块集合Pi;
Sa07、将模板子块集合Pi按子块的动态范围降序排列;
Sa08、设置当前模板子块P为模板子块集合Pi中第一个;
Sa09、在视野J中求模板子块P的可能重叠区域s;
Sa10、以模板子块P为模板,s为搜索区域,进行模板匹配搜索;
Sa11、将最佳匹配m加入结果集M;
Sa12、在结果集M中,找所有与m一致的匹配集视野合N;
Sa13、比对判断,N中权值和是否大于阈值v;
若否则,设置当前模板子块P为模板子块集合Pi中下一个,并返回Sa09;
若是则下一步;
Sa14、比对判断,视野j是否视野集合J中最后一个视野;
若否则设置视野j为视野集合J中下一个视野,并返回Sa05;
若是则下一步;
Sa15、比对判断,视野i为最后一个视野;
若否则设置i为下一个视野,并返回Sa03;
若是则输出结果。
3.根据权利要求1所述的一种用于显微图像全景拼接系统,其特征是:视野位置拟合的过程为:
Sa16、输入,初始化所有视野位置Xi、Yi;
Sa17、设置当前视野i为第一个视野;
Sa18、在子块匹配集M中,获得包含视野i的匹配子集Mi;
Sa19、根据匹配子集Mi,重新计算视野i的位置Xi、Yi;
Sa20、判断,所有视野更新完成;
若否则设置视野i为下一个视野;
若是则下一步;
Sa21、计算本轮视野位置和上轮视野位置偏差平均值L;
Sa22、比对判断,偏差平均值L小于阈值1;
若否则返回Sa17;
若是则下一步;
Sa23、视野位置归一化调整;
输出所有视野。
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