[发明专利]膀胱癌肿瘤突变基因特异性引物、试剂盒和文库构建方法有效
申请号: | 201910970970.7 | 申请日: | 2019-10-14 |
公开(公告)号: | CN110468211B | 公开(公告)日: | 2020-02-14 |
发明(设计)人: | 王龙;朱丽芳;陆利;曹曼曼;徐根明;潘艺;赵谦 | 申请(专利权)人: | 湖南大地同年生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11;C12Q1/6806;C40B50/06 |
代理公司: | 43114 长沙市融智专利事务所(普通合伙) | 代理人: | 袁靖 |
地址: | 410205 湖南省长沙市长沙*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 膀胱癌 特异性引物 肿瘤突变基因 单分子 富集 引物 检测 突变 特异性序列 测序序列 高效灵敏 技术应用 检测领域 临床应用 文库构建 有效提供 肿瘤基因 多重PCR 单引物 扩增子 试剂盒 制备 样本 | ||
1.膀胱癌肿瘤突变基因特异性引物,其特征在于,包括SEQ ID No.1-156所示序列的引物。
2.膀胱癌肿瘤突变基因检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的膀胱癌肿瘤突变基因特异性引物。
3.根据权利要求2所述的膀胱癌肿瘤突变基因检测试剂盒,其特征在于,包括以下三种组合之一:(1)和(2),(3)和(4),(5)和(6):
(1)按照说明书表1组合一中的浓度配制上游特异性引物组;
(2)按照说明书表1组合一中的浓度配制下游特异性引物组;
(3)按照说明书表1组合二中的浓度配制上游特异性引物组;
(4)按照说明书表1组合二中的浓度配制下游特异性引物组;
(5)按照说明书表1组合三中的浓度配制上游特异性引物组;
(6)按照说明书表1组合三中的浓度配制下游特异性引物组。
4.根据权利要求2所述的膀胱癌肿瘤突变基因检测试剂盒,其特征在于,还包括:对片段化核酸进行末端修复补平加A的末端修复反应试剂、对核酸进行分子标签接头连接的连接反应试剂。
5.膀胱癌肿瘤突变基因文库构建试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的膀胱癌肿瘤突变基因特异性引物。
6.根据权利要求5所述的膀胱癌肿瘤突变基因文库构建试剂盒,其特征在于,包括以下三种组合之一:(1)和(2),(3)和(4),(5)和(6):
(1)按照说明书表1组合一中的浓度配制上游特异性引物组;
(2)按照说明书表1组合一中的浓度配制下游特异性引物组;
(3)按照说明书表1组合二中的浓度配制上游特异性引物组;
(4)按照说明书表1组合二中的浓度配制下游特异性引物组;
(5)按照说明书表1组合三中的浓度配制上游特异性引物组;
(6)按照说明书表1组合三中的浓度配制下游特异性引物组。
7.根据权利要求5所述的膀胱癌肿瘤突变基因文库构建试剂盒,其特征在于,还包括:对片段化核酸进行末端修复补平加A的末端修复反应试剂、对核酸进行分子标签接头连接的连接反应试剂。
8.膀胱癌肿瘤突变基因检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)对待检DNA样本的片段化核酸进行末端修复补平加A;
(2)对末端修复补平加A的片段化核酸进行分子标签接头连接;
(3)将上游特异性引物组和下游特异性引物组,分别与分子标签引物组合,对连接接头产物进行扩增子法靶向富集;SEQ ID No.1-78所示序列为根据各个突变区域上游设计的上游特异性引物组;SEQ ID No.79-156所示序列为根据各个突变区域下游设计的下游特异性引物组;
(4)对扩增子法靶向富集产物进行PCR富集;对PCR富集产物检测。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,上游特异性引物组和下游特异性引物组包括以下三种组合之一:(1)和(2),(3)和(4),(5)和(6):
(1)按照说明书表1组合一中的浓度配制上游特异性引物组;
(2)按照说明书表1组合一中的浓度配制下游特异性引物组;
(3)按照说明书表1组合二中的浓度配制上游特异性引物组;
(4)按照说明书表1组合二中的浓度配制下游特异性引物组;
(5)按照说明书表1组合三中的浓度配制上游特异性引物组;
(6)按照说明书表1组合三中的浓度配制下游特异性引物组。
10.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述的突变包括点突变、缺失、插入、基因扩增、基因甲基化,基因融合中的一种或多种。
11.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,核酸片段包括DNA或RNA。
12.一种膀胱癌肿瘤突变基因文库构建方法,其特征在于,是采用权利要求8-11任一项所述的方法中步骤4)获得的PCR扩增产物进行文库构建。
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