[发明专利]膀胱癌肿瘤突变基因特异性引物、试剂盒和文库构建方法有效

专利信息
申请号: 201910970970.7 申请日: 2019-10-14
公开(公告)号: CN110468211B 公开(公告)日: 2020-02-14
发明(设计)人: 王龙;朱丽芳;陆利;曹曼曼;徐根明;潘艺;赵谦 申请(专利权)人: 湖南大地同年生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11;C12Q1/6806;C40B50/06
代理公司: 43114 长沙市融智专利事务所(普通合伙) 代理人: 袁靖
地址: 410205 湖南省长沙市长沙*** 国省代码: 湖南;43
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摘要:
搜索关键词: 膀胱癌 特异性引物 肿瘤突变基因 单分子 富集 引物 检测 突变 特异性序列 测序序列 高效灵敏 技术应用 检测领域 临床应用 文库构建 有效提供 肿瘤基因 多重PCR 单引物 扩增子 试剂盒 制备 样本
【权利要求书】:

1.膀胱癌肿瘤突变基因特异性引物,其特征在于,包括SEQ ID No.1-156所示序列的引物。

2.膀胱癌肿瘤突变基因检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的膀胱癌肿瘤突变基因特异性引物。

3.根据权利要求2所述的膀胱癌肿瘤突变基因检测试剂盒,其特征在于,包括以下三种组合之一:(1)和(2),(3)和(4),(5)和(6):

(1)按照说明书表1组合一中的浓度配制上游特异性引物组;

(2)按照说明书表1组合一中的浓度配制下游特异性引物组;

(3)按照说明书表1组合二中的浓度配制上游特异性引物组;

(4)按照说明书表1组合二中的浓度配制下游特异性引物组;

(5)按照说明书表1组合三中的浓度配制上游特异性引物组;

(6)按照说明书表1组合三中的浓度配制下游特异性引物组。

4.根据权利要求2所述的膀胱癌肿瘤突变基因检测试剂盒,其特征在于,还包括:对片段化核酸进行末端修复补平加A的末端修复反应试剂、对核酸进行分子标签接头连接的连接反应试剂。

5.膀胱癌肿瘤突变基因文库构建试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的膀胱癌肿瘤突变基因特异性引物。

6.根据权利要求5所述的膀胱癌肿瘤突变基因文库构建试剂盒,其特征在于,包括以下三种组合之一:(1)和(2),(3)和(4),(5)和(6):

(1)按照说明书表1组合一中的浓度配制上游特异性引物组;

(2)按照说明书表1组合一中的浓度配制下游特异性引物组;

(3)按照说明书表1组合二中的浓度配制上游特异性引物组;

(4)按照说明书表1组合二中的浓度配制下游特异性引物组;

(5)按照说明书表1组合三中的浓度配制上游特异性引物组;

(6)按照说明书表1组合三中的浓度配制下游特异性引物组。

7.根据权利要求5所述的膀胱癌肿瘤突变基因文库构建试剂盒,其特征在于,还包括:对片段化核酸进行末端修复补平加A的末端修复反应试剂、对核酸进行分子标签接头连接的连接反应试剂。

8.膀胱癌肿瘤突变基因检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)对待检DNA样本的片段化核酸进行末端修复补平加A;

(2)对末端修复补平加A的片段化核酸进行分子标签接头连接;

(3)将上游特异性引物组和下游特异性引物组,分别与分子标签引物组合,对连接接头产物进行扩增子法靶向富集;SEQ ID No.1-78所示序列为根据各个突变区域上游设计的上游特异性引物组;SEQ ID No.79-156所示序列为根据各个突变区域下游设计的下游特异性引物组;

(4)对扩增子法靶向富集产物进行PCR富集;对PCR富集产物检测。

9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,上游特异性引物组和下游特异性引物组包括以下三种组合之一:(1)和(2),(3)和(4),(5)和(6):

(1)按照说明书表1组合一中的浓度配制上游特异性引物组;

(2)按照说明书表1组合一中的浓度配制下游特异性引物组;

(3)按照说明书表1组合二中的浓度配制上游特异性引物组;

(4)按照说明书表1组合二中的浓度配制下游特异性引物组;

(5)按照说明书表1组合三中的浓度配制上游特异性引物组;

(6)按照说明书表1组合三中的浓度配制下游特异性引物组。

10.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述的突变包括点突变、缺失、插入、基因扩增、基因甲基化,基因融合中的一种或多种。

11.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,核酸片段包括DNA或RNA。

12.一种膀胱癌肿瘤突变基因文库构建方法,其特征在于,是采用权利要求8-11任一项所述的方法中步骤4)获得的PCR扩增产物进行文库构建。

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