[发明专利]甘蓝型油菜高矮性状紧密连锁的SNP标记及其应用有效

专利信息
申请号: 201910972241.5 申请日: 2019-10-14
公开(公告)号: CN110578015B 公开(公告)日: 2022-08-02
发明(设计)人: 王晓东;华玮;张洁夫;郑明;陈锋;张维;胡茂龙;彭琦;陈松;浦惠明 申请(专利权)人: 江苏省农业科学院;中国农业科学院油料作物研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 代理人: 王艳
地址: 210014 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 甘蓝 油菜 高矮 性状 紧密 连锁 snp 标记 及其 应用
【权利要求书】:

1.用于检测SNP标记的引物在鉴定或筛选甘蓝型油菜高矮性状中的应用,其特征在于,所述SNP标记包括BnaC09-42标记和BnaC09-54标记,所述引物为PARMS PCR扩增引物,所述引物包含:BnaC09-42位点扩增引物BnaC09-42-F、等位基因引物1:BnaC09-42-Rg和等位基因引物2:BnaC09-42-Ra;

其中,BnaC09-42位点扩增引物BnaC09-42-F为:

5'-AGTCTATGAAGAAAAACAACCCAAC-3',

等位基因引物1:BnaC09-42-Rg为:

5'-GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGTTATCTTGTATATATGTGGGTTTCTTATG-3',

等位基因引物2:BnaC09-42-Ra为:

5'-GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGTTATCTTGTATATATGTGGGTTTCTTATA-3';

和BnaC09-54位点扩增引物BnaC09-54-R、等位基因引物1:BnaC09-54-Fc和等位基因引物2:BnaC09-54-Ft;

其中,BnaC09-54位点扩增引物BnaC09-54-R为5'-CAAAGAGATTGCTTGCCACCC-3';

等位基因引物1:BnaC09-54-Fc为:

5'-GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGATCTTGGCCAACTAATATCTTTTC-3',

等位基因引物2:BnaC09-54-Ft为:

5'-GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGATCTTGGCCAACTAATATCTTTTT'-3';

所述SNP标记的基因型为CC时,甘蓝型油菜表现为高杆,所述SNP标记的基因型为TT时,甘蓝型油菜表现为矮杆;所述SNP标记的基因型为CT时,甘蓝型油菜表现为中杆;

所述甘蓝型油菜为中双11号与突变体DF09的杂交后代,所述突变体DF09保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,所述突变体DF09的保藏编号为CGMCC NO.18532。

2.一种检测甘蓝型油菜高矮性状的方法,其特征在于,具体包括以下步骤:

(1)提取待检测的油菜基因组DNA;

(2)以基因组DNA为模板,利用权利要求1所述的PARMS PCR扩增引物在荧光定量PCR仪中进行PCR扩增反应;

(3)根据荧光信号,进行基因型分型,其中,荧光信号与基因型CC一致,为高杆油菜;荧光信号与基因型TT一致,为矮杆油菜;荧光信号与基因型CT一致,为中杆油菜;

所述甘蓝型油菜为中双11号与突变体DF09的杂交后代,所述突变体DF09保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,所述突变体DF09的保藏编号为CGMCCNO.18532。

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