[发明专利]一种快速筛选基因编辑素材的方法有效
申请号: | 201910980345.0 | 申请日: | 2019-10-15 |
公开(公告)号: | CN110771513B | 公开(公告)日: | 2022-07-01 |
发明(设计)人: | 李雪梅;米其利;宋春满;李晶;孔维松;高茜;刘欣;许永;黄海涛;曾婉俐;向海英;许力;管莹;蒋佳芮;杨光宇 | 申请(专利权)人: | 云南中烟工业有限责任公司 |
主分类号: | A01H5/04 | 分类号: | A01H5/04;G01N33/00 |
代理公司: | 昆明正原专利商标代理有限公司 53100 | 代理人: | 金耀生 |
地址: | 650231*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 筛选 基因 编辑 素材 方法 | ||
1.一种快速筛选基因编辑素材的方法,其特征在于,步骤如下:
(1)采用相同的栽培条件对同批次移栽的基因编辑素材和对照亲本进行管理,栽培至植株现蕾期,采集现蕾期的基因编辑素材和对照亲本的新鲜烟叶,即刻冷冻干燥、粉碎,获得烟叶粉末;
(2)根据基因编辑位点及其生物信息学预测结果,确定素材待测的靶标代谢物化学成分,开展烟叶粉末中靶标代谢物化学成分的检测;
(3)采用区间分析法,将基因编辑素材中靶标代谢物化学成分的含量与对照亲本的靶标代谢物化学成分含量范围进行比对,获得靶标代谢物化学成分含量高于或低于对照亲本的基因编辑素材;
步骤(3)中基于三步法确定对照亲本的靶标代谢物化学成分的含量范围:首先采用四分位数极差法进行对照亲本样本检测数据中离群值的检验与剔除;然后对剔除离群值的数据,采用Shapiro-Wilk检验法进行分布检验,符合正态分布的则对照亲本成立;最后,采用95%置信区间法进行对照亲本的靶标代谢物化学成分含量范围的确定。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(1)中栽培条件为水培环境;对照亲本烟株的栽培数量≥30株;基因编辑素材包括T0代至Tn代的烟株。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(2)中烟叶粉末中靶标代谢物化学成分的检测,采用烟草行业标准规定的或实验室自建的方法进行。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,根据比对结果,将步骤(3)中经过比对的数据,在相应的数据表格中采用背景颜色填充进行区分标识:在对照亲本靶标代谢物化学成分含量范围内的基因编辑素材检测数据采用绿色背景标记;高于对照亲本靶标代谢物化学成分含量范围的基因编辑素材检测数据采用红色背景标记;低于对照亲本靶标代谢物化学成分含量范围的基因编辑素材检测数据采用蓝色背景标记。
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