[发明专利]氨氧化型亚硝化单胞菌菌株D23

权利要求书

1.一种优化的亚硝化单胞菌(N.eutropha)细菌的纯化制剂，其具有选自下列的至少一种特性：

优化的生长速率；

优化的NH₄⁺氧化速率；和

优化的NH₄⁺抗性。

2.根据权利要求1所述的亚硝化单胞菌细菌的制剂，其中所述优化的生长速率为允许具有约0.15-0.18的OD600(600nm下的光密度)的亚硝化单胞菌的连续培养物在约1至2天内达到约0.5-0.6的OD600的速率。

3.根据权利要求1或2所述的亚硝化单胞菌细菌的制剂，其中所述优化的生长速率为当在分批培养条件下培养时约8小时的倍增时间。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的亚硝化单胞菌细菌的制剂，其中所述优化的NH₄⁺氧化速率为至少约125微摩尔/分钟NH₄⁺氧化为NO₂^-的速率。

5.根据权利要求1至4中任一项所述的亚硝化单胞菌细菌的制剂，其中所述优化的NH₄⁺抗性是在包含约200mM NH₄⁺的培养基中生长至少约48小时的能力。

6.根据权利要求1至5中任一项所述的亚硝化单胞菌细菌的制剂，其具有选自优化的生长速率、优化的NH₄⁺氧化速率和优化的NH₄⁺抗性的至少两种特性。

7.根据权利要求1至6所述的亚硝化单胞菌细菌的制剂，其具有优化的生长速率、优化的NH₄⁺氧化速率和优化的NH₄⁺抗性。

8.根据权利要求1至7中任一项所述的亚硝化单胞菌细菌的制剂，其包含在极高严格度下与SEQ ID NO:1杂交的染色体。

9.根据权利要求1至8中任一项所述的亚硝化单胞菌细菌的制剂，其包含与SEQ ID NO:6或SEQ ID NO:12具有选自至少约80％、85％、90％、95％、98％、99％、99.5％和100％相同的同一性的AmoA蛋白，与SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:14具有选自至少约80％、85％、90％、95％、98％、99％、99.5％和100％相同的同一性的AmoB蛋白，与SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:10或SEQ ID NO:16具有选自至少约80％、85％、90％、95％、98％、99％、99.5％和100％相同的同一性的amoC基因，与SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:20或SEQ ID NO:22具有选自至少约80％、85％、90％、95％、98％、99％、99.5％和100％相同的同一性的羟胺氧化还原酶蛋白，与SEQID NO:24、SEQ ID NO:26或SEQ ID NO:28具有选自至少约80％、85％、90％、95％、98％、99％、99.5％和100％相同的同一性的细胞色素c554蛋白，或与SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:32具有选自至少约80％、85％、90％、95％、98％、99％、99.5％和100％相同的同一性的细胞色素c_M552蛋白。

10.根据权利要求1至9中任一项所述的亚硝化单胞菌细菌的制剂，其包含表2中的1-5个、5-10个、10-15个、15-20个、20-25个、25-30个或所有序列特征。