[发明专利]基于运动蛋白的基因转运速度控制装置的制造方法有效
申请号: | 201910996484.2 | 申请日: | 2019-10-19 |
公开(公告)号: | CN110669660B | 公开(公告)日: | 2023-03-24 |
发明(设计)人: | 陈昌;胡春瑞;豆传国 | 申请(专利权)人: | 上海新微技术研发中心有限公司 |
主分类号: | C12M1/36 | 分类号: | C12M1/36;C12M1/40;C12M1/34;G01N33/487 |
代理公司: | 苏州国卓知识产权代理有限公司 32331 | 代理人: | 明志会 |
地址: | 201800 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 运动 蛋白 基因 转运 速度 控制 装置 制造 方法 | ||
1.一种基于运动蛋白的基因转运速度控制装置的制造方法,步骤包括:
i)、形成具有多聚阴离子尾的运动蛋白;
ii)、提供纳米孔装置,包括壳体、流体腔密封层、柔性基底纳米孔结构、流体腔基座、电源、第一电极和第二电极,所述第一电极和所述第二电极分别与所述电源的两极相连接;
所述柔性基底纳米孔结构包括柔性基底、孔基底和纳米孔结构,所述纳米孔结构包括纳米孔腔、纳米孔;所述纳米孔腔贯穿所述孔基底,所述纳米孔是所述纳米孔腔的一端开口,所述纳米孔腔呈非线性缩小腔体或线性缩小腔体向所述纳米孔延伸;
所述纳米孔结构还包括:光栅,所述光栅围绕所述纳米孔腔,所述光栅形成于所述孔基底上远离所述纳米孔的面上,所述光栅由多组光栅槽构成;孔保护膜,覆盖所述光栅和所述纳米孔腔,所述孔保护膜包括二氧化硅层、至少两层二氧化硅层、或者至少两层金属氧化物层;金属层,覆盖所述孔保护膜,以缩小所述纳米孔尺寸至1~100nm;流体腔,由所述柔性基底不覆盖所述光栅和所述纳米孔腔、围绕所述光栅和所述纳米孔腔上方形成;
所述柔性基底纳米孔结构包括第一液体流道,所述第一液体流道连接外部与所述流体腔,以向所述流体腔输入或排出溶液;
所述流体腔基座包括流体下腔、第二液体流道,所述第二液体流道连接外部与所述流体下腔,以输入或排出所述流体下腔内溶液;
所述流体腔密封层密封所述流体腔;
所述壳体包括流道开口,分别与所述第一液体流道和第二液体流道对应;
使用电泳方法驱动所述多聚阴离子尾,多聚阴离子尾牵引所述运动蛋白,将所述运动蛋白稳定于所述纳米孔中;
切除所述多聚阴离子尾,以露出半胱氨酸的巯基;所述巯基与金属层表面形成金属-硫键,所述运动蛋白通过金属-硫键锚定于纳米孔中,以使待检测基因链通过所述纳米孔的转运速度至少慢于0.1ms每碱基对。
2.根据权利要求1所述的制造方法,其特征在于,所述运动蛋白包括DNA聚合酶、DNA螺旋酶或RNA聚合酶。
3.根据权利要求2所述的制造方法,其特征在于,所述DNA聚合酶是DNA聚合酶I-V、DNA聚合酶α, β, γ, δ, ε, ζ中的一种。
4.根据权利要求2所述的制造方法,其特征在于,所述DNA螺旋酶是超家族I-III、类DnaB家族、类ρ家族中的一种。
5.根据权利要求2所述的制造方法,其特征在于,所述DNA聚合酶是phi29 DNA聚合酶。
6.根据权利要求1所述的制造方法,其特征在于,所述金属层是铜、银、金、锌、汞、镉、钴、镍或铝中的一种。
7.根据权利要求1所述的制造方法,其特征在于,所述步骤i)中包括,使用基因工程方法对所述运动蛋白表面的氨基酸残基进行定点突变,替换成若干半胱氨酸,在部分所述半胱氨酸上连接巯基修饰的单链寡核苷酸(长度5-100 nt);提供一段含黏性末端的双链DNA(长度50-5000 bp),以与所述单链寡核苷酸上的单链寡聚物进行碱基互补配对,形成具有所述多聚阴离子尾的所述运动蛋白。
8.一种基于运动蛋白的基因转运速度控制装置的使用方法,使用根据权利要求1~7所述的制造方法制造的基于运动蛋白的基因转运速度控制装置,其特征在于,提供具有温度和pH值的含待检测基因链溶液,通过所述第一液体流道装载至所述流体腔中,自发扩散或电泳驱动至所述纳米孔腔内,被所述运动蛋白捕获后,待检测基因链在纳米孔51中的转运速度降低至0.1~999ms每碱基对。
9.根据权利要求8所述的使用方法,其特征在于,所述基因链是DNA链、RNA链,所述温度为25 ºC~-200ºC。
10.根据权利要求8所述的使用方法,其特征在于,所述基因链是DNA链、RNA链,所述pH值为1-13。
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