[发明专利]基于SNP标记CYP4F2rs3093168预测华法林出血风险的试剂盒在审

专利信息
申请号: 201910997462.8 申请日: 2019-10-18
公开(公告)号: CN110564844A 公开(公告)日: 2019-12-13
发明(设计)人: 尹彤;刘佳;吴阳勋 申请(专利权)人: 中国人民解放军总医院
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12N15/11
代理公司: 11245 北京纪凯知识产权代理有限公司 代理人: 白凤莹
地址: 100853*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 华法林 出血 试剂盒 预测 人基因组 多态性 基因型 检测 试剂盒制备 成套引物 临床环境 核苷酸 染色体 抗凝 评估 应用
【说明书】:

发明公开了一种基于SNP标记CYP4F2rs3093168预测华法林出血风险的试剂盒。本发明首先公开了用于检测SNP标记CYP4F2rs3093168的多态性或基因型的系统在预测或辅助预测华法林出血风险的产品中的应用;该SNP标记是人基因组的一个SNP位点,位于人基因组的19号染色体的第15885435位核苷酸,其为C或T。本发明进一步公开了用于检测上述SNP标记的多态性或基因型的成套引物和试剂盒。本发明用于预测或辅助预测华法林出血风险的试剂盒制备简单、使用方便;采用该试剂盒能检测出与华法林出血风险密切相关的SNP标记,结合临床环境因素,能够精准的评估华法林抗凝安全性。

技术领域

本发明涉及生物医药领域,具体涉及基于SNP标记CYP4F2rs3093168预测华法林出血风险的试剂盒。

背景技术

出血是华法林最常见和最致命的并发症,一直是人们关注的焦点,严重影响患者预后,是导致患者治疗中断、永久性致残甚至死亡的主要原因之一。在华法林抗凝治疗过程中,严重出血事件的发生率高达3.36%。影响华法林出血并发症的主要临床和环境因素包括:年龄、性别、抗凝强度、凝血指标监测情况、合并疾病以及合并用药等。近年来对华法林的药物基因组学研究发现,华法林代谢和作用相关基因的变异能够解释约50%的华法林剂量个体间差异,并且还与抗凝治疗期间华法林的出血并发症密切相关。

因此,挖掘出与华法林出血密切相关且具有潜在生物功能性的单核苷酸多态性(SNP)及其检测系统用于华法林出血风险预警和精准用药具有重要的意义。

发明内容

本发明要解决的技术问题为如何建立检测与华法林出血事件相关单核苷酸多态性(SNP)的检测系统,为华法林抗凝治疗提供药物基因组学参考指标。

为解决上述问题,本发明首先提供了用于检测SNP标记CYP4F2rs3093168的多态性或基因型的系统在预测或辅助预测华法林出血风险的产品中的应用;

所述SNP标记CYP4F2rs3093168是人基因组的一个SNP位点,所述SNP标记CYP4F2rs3093168位于人19号染色体的第15885435位(来源于GRCh38.p12数据库),其为C或T。

所述SNP标记CYP4F2rs3093168是人基因组的一个SNP位点,所述SNP标记CYP4F2rs3093168位于人基因组的19号染色体的第15885435位核苷酸,其为C或T。

上述SNP标记CYP4F2rs3093168位置是基于GRCh38.p12数据库确定的。

上述SNP标记CYP4F2rs3093168对应于序列表中序列1的第121位核苷酸,其为C或T(即序列1中y代表C或T)。

上述应用中,所述用于检测所述SNP标记CYP4F2rs3093168的多态性或基因型的系统包括用于检测所述SNP标记CYP4F2rs3093168的多态性或基因型的成套引物和/或试剂和/或试剂盒和/或仪器。

本发明进一步提供了用于检测所述SNP标记CYP4F2rs3093168的多态性或基因型的成套引物。

本发明用于检测所述SNP标记CYP4F2rs3093168的多态性或基因型的成套引物包括用于扩增包括所述SNP标记CYP4F2rs3093168在内的基因组DNA片段的PCR引物。

上述成套引物中,所述成套引物还包括用于检测包括所述SNP标记CYP4F2rs3093168在内的基因组DNA片段序列的测序引物。

具体的,所述PCR引物由序列2所示的单链DNA分子和序列3所示的单链DNA分子组成;

所述测序引物如序列表中序列4所示。

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