[发明专利]一种检测尼帕病毒的RAA引物探针及检测方法在审
申请号: | 201911002005.7 | 申请日: | 2019-10-21 |
公开(公告)号: | CN110592285A | 公开(公告)日: | 2019-12-20 |
发明(设计)人: | 吴晓东;樊晓旭;赵洋;蔡禹希;郭利川;应清界;李林;赵永刚;朱琳;王志亮 | 申请(专利权)人: | 中国动物卫生与流行病学中心;江苏奇天基因生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11 |
代理公司: | 37201 青岛海昊知识产权事务所有限公司 | 代理人: | 曾庆国 |
地址: | 266032 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 尼帕病毒 检测 荧光法检测 灵敏度 探针 引物 流行性乙型脑炎病毒 传染性胃肠炎病毒 口蹄疫病毒 伪狂犬病毒 猪细小病毒 猪圆环病毒 病毒质粒 反应检测 交叉反应 快速检测 猪瘟病毒 高通量 荧光法 质粒 病毒 概率 | ||
1.一种检测尼帕病毒的RAA荧光法扩增用的引物对,其特征在于,所述的引物对包含有序列为SEQ ID NO:4的上游引物和序列为SEQ ID NO:6的下游引物。
2.一种探针,其特征在于,所述的探针用于检测权利要求1所述的引物对的扩增产物。
3.如权利要求2所述探针,其特征在于,所述探针序列为SEQ ID NO:8。
4.如权利要求3所述的探针,其特征在于,所述的探针的采用荧光报告基团和荧光淬灭基团进行修饰,其中荧光报告基团修饰在探针序列离5′端碱基数31bp的位置上;荧光淬灭基团修饰在探针序列离3′端碱基数18bp的位置上,荧光报告基团与淬灭基团之间间隔1个碱基A,其中A用四氢呋喃残基替换。
5.如权利要求3所述的探针,其特征在于,所述的荧光报告基团为FAM、HEX、TET、JOE或VIC;所述荧光淬灭基团为BHQ1、BHQ2或BHQ3。
6.检测权利要求1所述的引物对和权利要求2-5任一项所述的探针在制备RAA荧光检测试剂盒中的应用。
7.一种RAA荧光检测试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒包含有权利要求1所述的引物对和权利要求2-5任一项所述的探针。
8.一种RAA荧光法检测尼帕病毒的方法,其特征在于,所述的方法包括如下的步骤:
1)提取待检测对象的核酸样品;
2)将恒温荧光基因检测仪接通电源进行预热,对反应参数进行设置;反应参数设置为39℃,反应时间:12min;
3)在25μL反应缓冲液中加入13.7μL水,权利要求1所述的上下游引物和权利要求2-5任一项所述的探针,充分混合后添加到RAA荧光基础反应试剂中混合,得到反应预混液;
4)在反应管盖上加2.5μL的Mg+,将4μL所述步骤1)中得到的核酸样品与所述步骤3)中得到的反应预混液充分混合,得到的反应体系放入恒温荧光基因检测仪检测荧光信号;
5)根据RAA-F1620检测仪器中的阳性判定方法,可以按扩增曲线来判定,有明显扩增曲线,且上游引物和下游引物扩增的曲线相对荧光值大于1500mV判定为阳性,无明显扩增曲线且相对荧光值小于1500mV的判定为阴性。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述的上游引物和下游引物的使用浓度为1~50μM;优选为10μM。
10.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述的探针的浓度为1~50μM;优选为10μM。
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