[发明专利]一种被动吸烟大鼠早期肝损伤模型建立方法及相关基因筛选方法有效
申请号: | 201911015600.4 | 申请日: | 2019-10-24 |
公开(公告)号: | CN110729022B | 公开(公告)日: | 2023-06-23 |
发明(设计)人: | 蔡继宝;苏加坤;徐达;郭磊;罗娟敏 | 申请(专利权)人: | 江西中烟工业有限责任公司 |
主分类号: | G16B5/00 | 分类号: | G16B5/00;G16B20/20;G16B40/00 |
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地址: | 330096 江西省南昌市*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 被动 吸烟 大鼠 早期 损伤 模型 建立 方法 相关 基因 筛选 | ||
1.一种被动吸烟大鼠早期肝损伤相关基因筛选方法,其特征在于,建立大鼠被动吸烟模型,通过肝脏基因芯片技术,筛选出被动吸烟大鼠早期肝损伤差异基因,并对其功能进行注释分析;
所述被动吸烟大鼠早期肝损伤差异基因有:Ccdc77、Eef2k 、Slc10a2、Fyn、Cacna1d、Samsn1、Rab30、Gstm6、Skap1、Cyp3a9、Nkain4、Odf2、Stap1、Timd4、Ppara、Abcg2、Arhgef15、Asrgl1、Arl4d、Fggy、Gimap7;
所述被动吸烟大鼠早期肝损伤差异基因影响的生物学功能有:T细胞受体信号通路;器官感应;跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路;蛋白质水解;配体缺失时胞外信号通路的负调节;纤毛组装的调节;细胞表面受体信号通路;信号转导的正向调节;树突形态的发生;细胞成分; T细胞受体复合物;α-β T细胞受体复合体;细胞外周;顶端质膜;细胞投影;顺式高尔基体网络;分子功能;术语描述;磷酸酪氨酸结合;SH3/SH2衔接子活性;金属羧肽酶活性;蛋白酶结合;脂质结合;类固醇羟化酶活性。
2.根据权利要求1所述的被动吸烟大鼠早期肝损伤相关基因筛选方法,其特征在于,所述大鼠被动吸烟模型建立方法为:每天进行60min时间主流烟气暴露染毒,烟气浓度控制在(1100±10%)mg/m 3 ,连续染毒30天。
3.根据权利要求2所述的被动吸烟大鼠早期肝损伤相关基因筛选方法,其特征在于,所述大鼠被动吸烟模型建立时,所用香烟参数为:烟碱1.0mg/支,焦油1.0mg/支,一氧化碳10.0mg/支。
4.根据权利要求1所述的被动吸烟大鼠早期肝损伤相关基因筛选方法,其特征在于,所述肝脏基因芯片为Agilent Rat lncRNA 2018版。
5.根据权利要求4所述的被动吸烟大鼠早期肝损伤相关基因筛选方法,其特征在于,所述肝脏基因芯片技术中,大鼠肝脏基因芯片数据采用Feature Extraction 软件(version10.7.1.1, Agilent Technologies)处理原始图像提取原始数据,接着利用Genespring软件(version 13.1, Agilent Technologies)进行quantile标准化和后续处理,标准化后的数据进行过滤,用于比较的每组样本中至少有一组100%标记为“P”的探针留下进行后续分析,利用倍数变化值进行差异基因和差异lncRNA筛选,筛选的标准为上调或者下调倍数变化值= 2.0且P值= 0.05,接着,对差异基因进行GO和KEGG富集分析,判定差异基因影响的生物学功能或者通路。
6.根据权利要求5所述的被动吸烟大鼠早期肝损伤相关基因筛选方法,其特征在于,所述被动吸烟大鼠早期肝损伤差异基因影响的通路有:原发性免疫缺陷;造血细胞谱系;化学致癌作用;T细胞受体信号通路;朊病毒疾病;亚油酸代谢;麻疹。
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