[发明专利]与牦牛乳冰点相关的SNP分子标记、引物组、试剂盒和应用

说明书

本发明提供了与牦牛乳冰点相关的SNP分子标记、引物组、试剂盒和应用，涉及基因诊断制品技术领域，所述SNP分子标记位于牦牛生长激素受体GHR基因SEQ ID NO.4所示核苷酸序列的第82位点，所述位点上存在C/T碱基突变，所述GHR基因的基因型为CC或CT，所述CT基因型冰点值低于CC基因型冰点值；所述SNP分子标记信息基于的牦牛基因序列为Genebank数据库中的AM161140.1。本发明提供的SNP分子标记与牦牛乳冰点显著相关，根据该SNP分子标记能够判断牦牛乳的冰点。

技术领域

本发明涉及基因诊断制品技术领域，具体涉及与牦牛乳冰点相关的SNP 分子标记、引物组、试剂盒和应用。

背景技术

SNP(single nucleotide polymorphism,SNP)，即单核苷酸多态性，是属于第三代遗传标记，广泛地分布于染色体上。SNP主要是指由基因组核苷酸水平上的变异引起的DNA序列多态性，而其中最少一种等位基因在群体中的频率不小于1％。包括单碱基的转换、颠换以及单碱基的插入和缺失等，例如，一个SNP可以将一个DNA序列AAGMCTAA变为ATGGCTAA。在基因组内，SNP可以划分为两种形式：一是遍布于基因组的大量单碱基突变；二是基因编码区的功能性突变，由于分布在基因编码区(coding region)，故又称其为cS-NP。cSNP经常引起表达蛋白的多态性变异，有时会影响他们的功能特性。

现有技术已有对牦牛GHR基因的多态性及生长发育的性状标记的研究，但并未发现牦牛GHR基因SNP与泌乳性状相关性研究的报道。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供与牦牛乳冰点相关的SNP分子标记、引物组、试剂盒和应用。本发明提供的SNP分子标记与牦牛乳冰点显著相关，根据该SNP分子标记能够判断牦牛乳的冰点。

为了实现上述发明目的，本发明提供以下技术方案：

本发明提供了与牦牛乳冰点相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记位于牦牛生长激素受体GHR基因SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列的第82 位点，所述位点上存在C/T碱基突变，所述GHR基因的基因型为CC或CT，所述CT基因型冰点值低于CC基因型冰点值；所述SNP分子标记信息基于的牦牛基因序列为Genebank数据库中的AM161140.1。

本发明还提供了一种检测GHR基因型的引物组，包括正向引物、反向引物和反向测序引物；

所述正向引物具有SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列，所述反向引物具有 SEQ IDNO.2所示的核苷酸序列，所述反向测序引物具有SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。

本发明还提供了一种检测GHR基因型的试剂盒，包括dNTPs、Taq DNA 聚合酶、MgCl₂和PCR反应缓冲液和上述技术方案所述的引物组。

优选地，所述引物组中正向引物和反向引物的浓度独立的为10μmol/L。

本发明还提供了所述的SNP分子标记在检测牦牛乳冰点中的应用。

本发明提供了与牦牛乳冰点相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记位于牦牛生长激素受体GHR基因SEQ ID NO.4的第82位点，所述位点上存在C/T碱基突变，所述GHR基因的基因型为CC或CT，所述CT基因型冰点值显著低于CC基因型冰点值；所述SNP分子标记信息基于的牦牛基因序列为Genebank数据库中的AM161140.1。本发明提供的SNP分子标记与牦牛乳冰点显著相关，根据该SNP分子标记能够判断牦牛乳的冰点。

附图说明

图1为牦牛GHR基因SEQ ID NO.4所在序列不同样本间的序列对比图，可直观看出第82位点碱基的突变情况；

图2为牦牛GHR基因SEQ ID NO.4序列PCR扩增后通过单向测序方法检测出突变位点的测序图谱。