[发明专利]一种来源于尤卡坦氏棉与棉花纤维强度QTL连锁的分子标记及其应用

说明书

本发明公开一种与尤卡坦氏棉纤维强度QTL连锁的分子标记，该分子标记为分子标记INTR1027和分子标记JESPR‑231，所述分子标记INTR1027的正向引物序列如SEQ ID NO.1所示，反向引物序列如SEQ ID NO.2所示；所述分子标记JESPR‑231的正向引物序列如SEQ ID NO.3所示，反向引物序列如SEQ ID NO.4所示。使用本发明的分子标记可以从分子水平上选择带有尤卡坦氏棉特征条带的植株，所选单株或株系的纤维强度得到不同程度的提高，进而可以快速筛选纤维强的材料用于棉花纤维品质育种，分子标记辅助选择目标明确，成本低，育种进程加快。

技术领域：

本发明属于生物技术育种领域，具体涉及一种来源于尤卡坦氏棉与棉花纤维强度QTL连锁的分子标记及其应用。

背景技术

棉花是世界上重要的经济作物，棉纤维是重要的纺织工业原料。随着纺织工业的快速发展和人民生活水平的不断提高，人们对棉花纤维品质的要求也越来越高。陆地棉由于产量高、适应性广而被大面积种植。一直以来，棉花育种工作者主要集中在棉花产量的提高上，使得我国的棉花品种大多表现为产量高，品质中等或偏低。纤维品质育种已成为棉花分子育种的一个重要目标，纤维强度是纤维品质性状的一项重要指标，提高纤维强度不仅可以满足现代纺纱技术，同时也可以提高纺织品质量。因此，提高棉花纤维强度是现代棉花育种的目标之一。陆地棉半野生种尤卡坦氏棉起源于中美洲墨西哥的尤卡坦半岛，具有高纤维强度潜力的特性，挖掘高纤维强度基因，并转移到陆地棉栽培种背景中，对我国陆地棉纤维品质的改良有着重要的意义。

传统的育种方法主要是基于表型的选择，由于纤维品质(包括纤维强度)性状是典型的数量性状，这种方法对纤维品质来说，存在准确性差、效率低等许多缺点。尤其是纤维产量和品质存在着显著的负相关，传统的育种方法很难打破这种负相关，那么在保证产量的同时提高品质成为了当前育种的主要瓶颈。理想的方法应该是能够直接对性状相关的基因型进行选择，从分子水平上有效地避免环境以及负连锁的影响，从而达到保优保质的育种目的。

分子标记辅助选择是借助分子标记对目标性状的基因型直接进行选择，可以减少来自同一位点不同等位基因或不同位点的非等位基因间的相互干扰，克服不利性状连锁，并且不必考虑作物生长时期和发育条件以及环境的影响，可在早期进行选择，从而加快育种进程；少量的群体种植规模，减少工作量，极大地缩短了育种时间。分子标记辅助选择对同步改良产量和纤维品质、快速培育棉花新品种具有无比优越性。随着现代分子技术的发展，科研工作者或育种工作者利用不同的海-陆和陆-陆群体进行连锁图谱的构建和重要纤维品质性状的筛选，已经取得了很大研究进展。这些研究结果为纤维品质性状的分子标记辅助选择打下了良好的基础,有些结果已被应用于分子标记辅助选择育种中(张天真等，2011；卢全伟等，2018)。染色体片段渐渗系(Chromosome segment introgression lines，CSIL)是利用杂交、回交和分子标记辅助选择(marker-assisted selection,MAS)构建的覆盖作物整个基因组的一系列近等基因系。它的基因组内只有来自供体亲本的一个纯合的染色体片段，而基因组的其余部分与轮回亲本相同。它是进行基因组研究、QTL定位和分子设计育种的理想材料，特别是单片段渐渗系，其在准确鉴定QTL以及育种应用到中具有很大的优势。

发明内容

传统的育种方法在棉花纤维品质(包括纤维强度)改良上存在准确性差、效率低等许多缺点。为了克服这种缺点，本发明提供一种来源于尤卡坦氏棉与棉花纤维强度紧密连锁的分子标记，可用于分子标记辅助选择育种，提高棉花推广品种的纤维强度。使用本发明的分子标记可以从分子水平上选择带有尤卡坦氏棉特征条带的植株，所选单株或株系的纤维强度得到不同程度的提高，进而可以快速筛选纤维强的材料用于棉花纤维品质育种，分子标记辅助选择目标明确，成本低，育种进程加快。

本发明的目的可以通过以下技术方案实现：