[发明专利]胃癌预后诊断标志物TREM1的应用及检测试剂盒在审
申请号: | 201911029436.2 | 申请日: | 2019-10-28 |
公开(公告)号: | CN110656178A | 公开(公告)日: | 2020-01-07 |
发明(设计)人: | 康亚妮;秦玉兰;俞焙秦 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574 |
代理公司: | 31220 上海旭诚知识产权代理有限公司 | 代理人: | 郑立 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 胃癌 标志物 预后 预后诊断 评估 特异性和敏感性 生物医学领域 相对表达量 表达水平 分子水平 检测试剂 临床应用 医疗成本 预后检测 个体化 检测 分层 分级 内参 引物 治疗 应用 分类 节约 预测 | ||
1.一种胃癌预后诊断标志物TREM1在胃癌预后检测及评估中的应用,其特征在于,所述应用是通过检测所述标志物TREM1的相对表达水平来评估胃癌患者预后情况。
2.如权利要求1所述的胃癌预后诊断标志物TREM1在胃癌预后检测及评估中的应用,其特征在于,所述标志物TREM1的相对表达水平的检测方法可以采用qPCR法,具体包括以下步骤:
步骤1、获取胃癌组织样本和对照组织样本,研磨,提取总RNA样品;
步骤2、将所述步骤1制得的所述总RNA样品进行反转录;
步骤3、将所述步骤2得到的反转录产物进行qPCR反应,并计算所述标志物TREM1的相对表达量。
3.如权利要求2所述的胃癌预后诊断标志物TREM1在胃癌预后检测及评估中的应用,其特征在于,所述步骤2中需要先将所述总RNA样品中的基因组DNA去除。
4.如权利要求2所述的胃癌预后诊断标志物TREM1在胃癌预后检测及评估中的应用,其特征在于,所述qPCR反应中需要所述标志物TREM1的引物和内参,其中,所述标志物TREM1的引物可选择DNA序列为5’-TGTGATCTACCAGCCTCCCA-3’的正向引物和DNA序列为5’-GGGGTCCCTGAAAAACCCTT-3’的反向引物;所述内参选择GAPDH时,所述内参的正向引物的DNA序列为5’-CCTCATCTGGGATGCTGAAT-3’,所述内参的反向引物的DNA序列为5’-GCTGCGGGCTCAATTTATAG-3’。
5.如权利要求2所述的胃癌预后诊断标志物TREM1在胃癌预后检测及评估中的应用,其特征在于,所述步骤1中的所述对照组织样本可选择胃癌旁组织。
6.如权利要求2所述的胃癌预后诊断标志物TREM1在胃癌预后检测及评估中的应用,其特征在于,所述步骤1中所述研磨需要的器具需经过液氮预冷,且在所述研磨的过程中需要不断补充液氮保持超低温状态。
7.如权利要求2所述的胃癌预后诊断标志物TREM1在胃癌预后检测及评估中的应用,其特征在于,所述标志物TREM1的相对表达量的计算方法为:TREM1表达量的倍数变化=2-(ΔCt(胃癌组织样本)-ΔCt(对照组织样本)),其中ΔCt(胃癌组织样本)=Ct(胃癌组织样本中的TREM1)-Ct(胃癌组织样本中的内参),ΔCt(对照组织样本)=Ct(对照组织样本中的TREM1)-Ct(对照组织样本中的内参)。
8.如权利要求1所述的胃癌预后诊断标志物TREM1在胃癌预后检测及评估中的应用,其特征在于,所述标志物TREM1的相对表达水平还可采用抗TREM1的特异性抗体进行检测。
9.一种胃癌预后诊断标志物TREM1检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括所述标志物TREM1的引物和内参。
10.如权利要求9所述的胃癌预后诊断标志物TREM1检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒可用于检测所述标志物TREM1的相对表达量。
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