[发明专利]检测人肠道细菌的组合物、试剂盒及方法有效
申请号: | 201911037195.6 | 申请日: | 2019-10-29 |
公开(公告)号: | CN110699468B | 公开(公告)日: | 2023-05-02 |
发明(设计)人: | 任小梅;刘佳;邓中平;戴立忠 | 申请(专利权)人: | 圣湘生物科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/14;C12Q1/06;C12R1/46;C12R1/145;C12R1/01 |
代理公司: | 北京派特恩知识产权代理有限公司 11270 | 代理人: | 胡亮;张颖玲 |
地址: | 410205 湖南省长*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 肠道 细菌 组合 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测肠道细菌的组合物,所述肠道细菌由双歧杆菌属、链球菌属、拟杆菌属、乳酸菌属、柔嫩梭菌、普拉梭菌和直肠真杆菌组成,所述组合物包括:
BIF的检测试剂:如SEQ ID NO:1所示的BIF上游引物、如SEQ ID NO:2所示的BIF下游引物和如SEQ ID NO:5所示的BIF探针;
STR的检测试剂:如SEQ ID NO:3所示的STR上游引物、如SEQ ID NO:4所示的STR下游引物和如SEQ ID NO:6所示的STR探针;
LAC的检测试剂:如SEQ ID NO:7所示的LAC上游引物、如SEQ ID NO:8所示的LAC下游引物和如SEQ ID NO:11所示的LAC探针;
BAC的检测试剂:如SEQ ID NO:9所示的BAC上游引物、如SEQ ID NO:10所示的BAC下游引物和如SEQ ID NO:12所示的BAC探针;
FAE的检测试剂:如SEQ ID NO:13所示的FAE上游引物、如SEQ ID NO:14所示的FAE下游引物和如SEQ ID NO:19所示的FAE探针;
CLEP的检测试剂:如SEQ ID NO:15所示的CLEP上游引物、如SEQ ID NO:16所示的CLEP下游引物和如SEQ ID NO:20所示的CLEP探针;以及
ER的检测试剂:如SEQ ID NO:17所示的ER上游引物、如SEQ ID NO:18所示的ER下游引物和如SEQ ID NO:21所示的ER探针;
其中,所述组合物以3个试剂组合的形式存在:
试剂组合1:FAE的检测试剂、CLEP的检测试剂和ER的检测试剂;
试剂组合2:BIF的检测试剂、STR的检测试剂、LAC的检测试剂和BAC的检测试剂中的任意两种;以及
试剂组合3:其余两种检测试剂。
2.根据权利要求1所述的组合物,其中,所述组合物以3个试剂组合的形式存在:
试剂组合1:FAE的检测试剂、CLEP的检测试剂和ER的检测试剂;
试剂组合2:LAC的检测试剂和BAC的检测试剂;以及
试剂组合3:BIF的检测试剂和STR的检测试剂。
3.根据权利要求2所述的组合物,其中,所述试剂组合1中的各探针的荧光基团彼此不同;所述试剂组合2中的各探针的荧光基团彼此不同;所述试剂组合3中的各探针的荧光基团彼此不同。
4.根据权利要求3所述的组合物,其中,所述试剂组合中的探针的荧光报告基团选自FAM、HEX、ROX、VIC、CY5、5-TAMRA、TET、CY3和JOE。
5.根据权利要求4所述的组合物,其中,如SEQ ID NO:5、11、19所示的探针的荧光基团为FAM,如SEQ ID NO:6、12、20所示的探针的荧光基团为HEX;SEQ ID NO:21所示的探针的荧光基团为ROX。
6.权利要求1~5中任一项所述的组合物在制备检测人肠道细菌的试剂盒中的用途。
7.一种用于检测人肠道细菌的试剂盒,所述试剂盒包括上述权利要求1~5中任一项所述的组合物。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其中,所述试剂盒还包括核酸提取试剂、dNTP、Mg2+、DNA聚合酶、PCR缓冲液中的至少一种。
9.根据权利要求8所述的试剂盒,其中,各组分的终浓度的范围如下所示:Mg2+ 2~6mM、dNTP 0.1~0.4mM、DNA聚合酶2~30U、引物100~500nM、探针50~250nM。
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