[发明专利]基于游离DNA甲基化或羟甲基化差异的主动脉夹层检测方法及系统

权利要求书

1. 一种基于游离DNA甲基化或羟甲基化差异的主动脉夹层检测方法，其特征在于，利用游离DNA甲基化或DNA羟甲基化差异作为检测分子标记，具体步骤为：

（一）游离DNA甲基化或羟甲基化差异检测

收集主动脉夹层患者、正常人和其他病人游离DNA的甲基化或羟甲基化数据；

（1）检测主动脉夹层病人和正常人或其他病人血液游离DNA的整体甲基化或羟甲基化水平有统计学差异（t检验，p<0.1）；

（2）检测主动脉夹层病人和正常人或其他病人血液游离DNA的特定位点或区域甲基化或羟甲基化水平有统计学差异（t检验，p<0.1）；

（3）检测主动脉夹层病人和正常人或其他病人血液游离DNA甲基化或羟甲基化在基因组中的分布规律差异；

（二）根据DNA甲基化或羟甲基化差异检测主动脉夹层的发生

（1）选择步骤（一）中差异（1）-（3）中的一种为判断分子标记，根据已有的主动脉夹层患者，正常人及其他病人游离DNA的甲基化或羟甲基化数据，建立分类模型，或者拟定正常值参考范围；

（2）对于由DNA甲基化或DNA羟甲基化检测技术得到的待检测样品DNA甲基化或羟甲基化数据，根据上述建立的分类模型或拟定的正常值范围，判断主动脉夹层是否发生。

2.根据权利要求1所述的检测方法，其特征在于，所述特定位点选自HOX基因家族中HOXA5、HOXA6、HOXC6基因家族启动子区。

3.根据权利要求1所述的检测方法，其特征在于，所述DNA甲基化或DNA羟甲基化检测技术选自全基因组甲基化测序、焦磷酸测序、DNA甲基化免疫共沉淀技术、DNA羟甲基化免疫共沉淀技术以及5-羟甲基胞嘧啶选择性标记技术。

4.基于权利要求1所述检测方法的主动脉夹层检测系统，其特征在于，包括：游离DNA甲基化或羟甲基化差异检测模块，主动脉夹层判别模块；其中：

所述游离DNA甲基化或羟甲基化差异检测模块，包括3个子模块：

（1）主动脉夹层病人和正常人或其他病人血液游离DNA的整体甲基化或羟甲基化水平有统计学差异（t检验，p<0.1）检测子模块；

（2）主动脉夹层病人和正常人或其他病人血液游离DNA的特定位点或区域甲基化或羟甲基化水平有统计学差异（t检验，p<0.1）检测子模块；

（3）主动脉夹层病人和正常人或其他病人血液游离DNA甲基化或羟甲基化在基因组中的分布规律差异检测子模块；

所述主动脉夹层判别模块，包括2个子模块：（1）分类子模块；（2）判断子模块；分类子模块中，根据游离DNA甲基化或羟甲基化差异检测模块中3个子模块的检测结果建立分类模型，或者拟定正常值参考范围；判断子模块中，根据得到的待检测样品DNA甲基化或羟甲基化数据，与分类子模块中建立的分类模型或拟定的正常值范围进行比较，判断主动脉夹层是否发生。