[发明专利]检测烟蚜对吡虫啉抗药性的引物对及检测方法有效

专利信息
申请号: 201911055392.0 申请日: 2019-10-31
公开(公告)号: CN110607378B 公开(公告)日: 2022-11-29
发明(设计)人: 孟建玉;杨昌利;张长禹;赵瑞娟 申请(专利权)人: 贵州省烟草科学研究院
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/6806;C12N15/11
代理公司: 贵阳中新专利商标事务所 52100 代理人: 张行超
地址: 550081 贵州*** 国省代码: 贵州;52
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摘要:
搜索关键词: 检测 吡虫啉 抗药性 引物 方法
【权利要求书】:

1.一种检测烟蚜对吡虫啉抗药性的方法,其特征在于,包括以下步骤:

S1,提取待检测烟蚜样本RNA;

S2,将RNA反转录成DNA;

S3,以DNA作为模板,以引物对作为扩增引物,进行PCR扩增,其中,所述引物对的上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;

S4,对扩增产物回收纯化;

S5,将纯化后的目的片段连接到载体;

S6,将连接产物转入感受态细胞,培养获取菌液;

S7,对菌液进行测序判别:以烟蚜敏感种群目的基因氨基酸序列作为参比序列来进行判别,如果出现第169位的缬氨酸变成丙氨酸、第244位的甘氨酸变成精氨酸和第515位的异亮氨酸变成苏氨酸三个位点同时突变,则判定所测烟蚜样本对吡虫啉产生了抗性;

其中,所述参比序列如下:

MAAKDVKFGNEARIKMLRGVNVLADAVKVTLGPKGRNVVLDKSFGAPSITKDGVSVAREIELEDKFENMGAQMVKEVASKANDAAGDGTTTATLLAQSIVNEGLKAVAAGMNPMDLKRGIDKAVISAVEELKNLSVPCSDSKAITQVGTISANADEKVGALIAEAMEKVGNDGVITVEEGTGLQNELEVVKGMQFDRGYLSPYFINKPETGIVELENPYILMADKKISNVREMLPILESVAKSGKPLLIISEDLEGEALATLVVNSMRGIVKVAAVKAPGFGDRRKAMLQDISILTGGSVISEELAMELEKSTLEDLGQAKRVVISKDTTTIIGGVGEKHTIQSRISQIRQEIQEATSDYDKEKLNERLAKLSGGVAVLKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGVVAGGGVALVRVAGKISNLRGQNEDQNVGIRVALRAMEAPLRQIVSNSGEEPSVVTNNVKDGKGNYGYNAATDEYGDMIDFGILDPTKVTRSALQYAASVAGLMITTECMVTDLPKEDKSSDSNSSPAGGMGGMGGMM。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增使用的反应体系为:

DNA模板1μL,上游引物1μL,下游引物1μL,12.5μL Ex Primer TaqTM,9.5μL ddH2O;总体积25μL,上游引物和下游引物的浓度均为10μM;

所述PCR扩增使用的反应条件为:94℃预变性3min;然后94℃变性30s,53℃退火30s,72℃延伸1min,共35个循环;最后72℃延伸5min;4℃保存;完成PCR扩增。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述目的片段连接的反应体系为:1μLpMD19-TVector,4μL目的片段,5μL Solution I;反应条件为:微离心混匀后,16℃连接过夜,得连接液。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述连接产物加入感受态细胞培养获取菌液的方法为:

(1)在连接液中加入10μLDH5α感受态细胞,冰上放置30min,轻弹;

(2)42℃水浴45s,取出冰上放置1min;

(3)加入890μL LB液体培养基,37℃,150rpm振荡培养60min;

(4)取0.25mL灭菌PCR管,加入30μL无菌水,用10μL的枪头在过夜培养的平板上挑取阳性单菌落溶于无菌水中;

(5)在0.25mL的RCR管中配制25μL的PCR反应体系,进行菌落PCR鉴定:12.5μL ExPrimer TaqTM、0.5μL上游引物、0.5μL下游引物、3μL菌液、8.5μL ddH2O,上游引物和下游引物的浓度均为10μM;

(6)上述反应体系按按以下程序进行PCR反应:94℃预变性3min;然后94℃变性30s,53℃退火30s,72℃延伸1min,共35个循环;最后72℃延伸5min;4℃保存样品;

(7)1.0%琼脂糖凝胶电泳检测,电泳条件:130V,25min;

(8)将检测有条带的菌液加入含0.1%Amp的LB液体培养基中,37℃扩大培养。

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