[发明专利]一种检测非粘液型肺炎克雷伯菌毒力的方法在审

专利信息
申请号: 201911063408.2 申请日: 2019-11-04
公开(公告)号: CN110669853A 公开(公告)日: 2020-01-10
发明(设计)人: 黄维;邹全明;张敏;章金勇;胡春霞;惠真;邓秋洋;钟裕欣;柳施一;崔瑞勤 申请(专利权)人: 深圳市人民医院
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/10;C12R1/22
代理公司: 51211 成都天嘉专利事务所(普通合伙) 代理人: 赵丽
地址: 518020 广东省深*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 肺炎 非粘液 菌毒力 定性检测 标志物 毒力 聚合酶链反应 生物检测技术 特异性序列 设计引物 粘液 高毒力 基因组 种检测 检测 菌株 基因 应用 保证
【权利要求书】:

1.一种检测非粘液型肺炎克雷伯菌毒力的方法,其特征在于,包括如下步骤:

S1:将待检测的非粘液型肺炎克雷伯菌接种于培养基中,培养,取OD600nm为0.6~0.8的培养液为待检测的非粘液型肺炎克雷伯菌样品;

S2:分别取PCR反应液、上游引物、下游引物、阳性对照、阴性对照、经步骤S1所得的待检测的非粘液型肺炎克雷伯菌样品及灭菌水,进行PCR扩增体系配制,其中,

所述上游引物序列为5’- AACAGGCGGCTGAACATACA-3’,所述下游引物序列为5’-TTTACCCTGCTGCGCTCATT-3’;

所述阳性对照为经全基因组测序确定含有标志物ampR基因且动物实验呈高致死率的非粘液型肺炎克雷伯菌核酸;所述阴性对照为经全基因组测序确定不含有标志物ampR基因且动物实验呈非致死性的非粘液型肺炎克雷伯菌核酸;

所述标志物ampR基因序列如SEQ ID NO.1所示;

S3:将经步骤S2所得的PCR扩增体系分别在转速为3000rpm的条件下,离心30s,再放置于PCR仪中扩增;

S4:将经步骤S3扩增反应后的产物分别进行电泳,观测182bp处对应是否出现条带,并作结果分析。

2.根据权利要求1所述的检测非粘液型肺炎克雷伯菌毒力的方法,其特征在于,在PCR扩增体系中,所述PCR反应液包括浓度为5U/μL Taq聚合酶、浓度为200mmol/L三羟甲基氨基甲烷盐酸盐溶液、浓度为20mmol/L氯化镁溶液、浓度为500mmol/L氯化钾溶液、体积比为0.2%曲拉通溶液、体积比为10%甲酰胺溶液以及浓度为10mmol/L脱氧核糖核苷三磷酸。

3.根据权利要求1所述的检测非粘液型肺炎克雷伯菌毒力的方法,其特征在于,在PCR扩增体系中,所述上游引物及下游引物浓度均为0.5μmol/L。

4.根据权利要求1所述的检测非粘液型肺炎克雷伯菌毒力的方法,其特征在于,在PCR扩增体系配制中,取至少四个PCR管,并分别编号为阳性对照管、阴性对照管、实验管及空白对照管;其中,

阳性对照管中加入17μL PCR反应液、1μL上游引物、1μL下游引物及1μL阳性对照;

阴性对照管中加入17μL PCR反应液、1μL上游引物、1μL下游引物及1μL阴性对照;

实验管中加入17μL PCR反应液、1μL上游引物、1μL下游引物及1μL经步骤S1所得的待检测的非粘液型肺炎克雷伯菌样品;

空白对照管中加入17μL PCR反应液、1μL上游引物、1μL下游引物及1μL灭菌水。

5.根据权利要求1所述的检测非粘液型肺炎克雷伯菌毒力的方法,其特征在于,在步骤S3中,所述扩增反应的条件为:

在94℃条件下反应3min;然后35个循环,其中,包括依次在94℃条件下反应30s,在60℃条件下反应30s,在72℃条件下反应30s;最后,在72℃条件下反应5min,然后在4℃条件下保持。

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