[发明专利]一种基于CRISPR/Cas9转变水稻果皮色的基因编辑方法及其应用在审
申请号: | 201911079333.7 | 申请日: | 2019-11-07 |
公开(公告)号: | CN110846314A | 公开(公告)日: | 2020-02-28 |
发明(设计)人: | 戴伟民;强胜;宋小玲;孔梦瑶;孙茜茜 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/82;A01H5/10;A01H4/00;A01H6/46 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 竞存;徐冬涛 |
地址: | 211225 江苏省南京市溧*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 crispr cas9 转变 水稻 果皮 基因 编辑 方法 及其 应用 | ||
1.一种基于CRISPR/Cas9转变水稻果皮色的gRNA spacer-Rc1序列,其特征在于,所述gRNA spacer-Rc1的核苷酸序列包括
gRNA-Spacer-Rc1F:5’-GGCAGGGGCGGGAAAGGCGCAAG-3’(SEQ ID NO.1),和
gRNA-Spacer-Rc1R:5’-AAACCTTGCGCCTTTCCCGCCCC-3’(SEQ ID NO.2)。
2.CRISPR/Cas9-gRNA-spacer表达载体pRGEB32-Rc 1的构建方法,其特征在于,所述构建方法包括以下步骤:
(1)将SEQ ID NO.1所示gRNA-Spacer-Rc1F和SEQ ID NO.2所示gRNA-Spacer-Rc1R退火形成双链;
(2)采用BsaI酶切质粒pRGEB32,连接gRNA spacer-Rc1F和gRNA spacer-Rc1R形成的双链,构建得到表达载体pRGEB32-Rc 1;
(3)使用引物pRGEB32-3对表达载体pRGEB32-Rc 1进行PCR扩增,送测序公司测序验证,如测序结果包括SEQ ID NO.1所示序列,即表示为构建成功的pRGEB32-Rc 1。
3.根据权利要求2所述CRISPR/Cas9-gRNA-spacer表达载体pRGEB32-Rc 1的构建方法,其特征在于,步骤(1)中所述gRNA-Spacer-Rc1F和gRNA-Spacer-Rc1R的退火体系为10μl体系:gRNA-Spacer-Rc1F 1ul(100μM);gRNA-Spacer-Rc1R 1ul(100μM);10×T4 DNA连接酶缓冲液1μl(50mMTris-HCl,10mM MgCl2,10mM DTT,1mM ATP,pH7.5,25℃);ddH20 7μl;将PCR管放于PCR仪,37℃60min,95℃10min,自然冷却至25℃1min,以形成双链。
4.根据权利要求2所述CRISPR/Cas9-gRNA-spacer表达载体pRGEB32-Rc 1的构建方法,其特征在于,步骤(3)中所述引物pRGEB32-3包括:
pRGEB32-3-F:5’-CTGGGTACGTTGGAAACCAC-3’(SEQ ID NO.3),
pRGEB32-3-R:5’-CGGCCCAAATTGAAAAGATA-3’(SEQ ID NO.4);
所述表达载体pRGEB32-Rc 1的PCR扩增体系为2×PCR Mix 4.0μL,ddH2O 4.5μL,pRGEB32-3-F(10μmol/L)0.25μL,pRGEB32-3-R(10μmol/L)0.25μL,DNA(10-20ng/μL)1μL,
PCR反应程序为:94℃下预变性5min;94℃下变性45s,55℃下退火45s,72℃下延伸lmin,30个循环;72℃下延伸8min。
5.基于权利要求2至4任一项权利要求所述的构建方法构建得到的CRISPR/Cas9-gRNA-spacer表达载体pRGEB32-Rc 1。
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