[发明专利]一种人血浆PTEN基因甲基化检测试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201911080566.9 | 申请日: | 2019-11-07 |
公开(公告)号: | CN110747272A | 公开(公告)日: | 2020-02-04 |
发明(设计)人: | 赵晨阳;杨金波;张斌 | 申请(专利权)人: | 上海中科生物医学高科技开发有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 31334 上海段和段律师事务所 | 代理人: | 陈少凌;郭国中 |
地址: | 201100 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 特异引物 启动子区 甲基化 非甲基化 创伤性 试剂盒 甲基化检测 手术标本 特异性强 位点设计 位置设计 检出率 人血浆 检测 富集 | ||
1.一种人血浆PTEN基因甲基化的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:针对人PTEN基因启动子区中CpG富集位点设计的甲基化特异引物对,以及针对人PTEN基因启动子区-978至-786位置设计的非甲基化特异引物对。
2.根据权利要求1所述的人血浆PTEN基因甲基化的检测试剂盒,其特征在于,所述甲基化特异引物对的序列如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示。
3.根据权利要求1所述的人血浆PTEN基因甲基化的检测试剂盒,其特征在于,所述非甲基化特异引物对的序列如SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的人血浆PTEN基因甲基化的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括血浆收集试剂、血浆游离DNA提取试剂、血浆游离DNA的CT转换处理试剂和荧光定量MSP扩增试剂。
5.根据权利要求4所述的人血浆PTEN基因甲基化的检测试剂盒,其特征在于,
所述血浆收集试剂含:抗凝剂;
所述血浆游离DNA提取试,含:裂解液GHH、Proteinase K、Carrier RNA、磁珠、缓冲液、漂洗液、洗脱缓冲液;
所述血浆游离DNA的CT转换处理试剂含:CT Conversion粉剂、M-Dilution Buffer、M-Dissolving Buffer、水、M-Binding buffer、M-Wash Buffer、M-Desulphonation Buffe、HPLC级水;
所述荧光定量MSP扩增试剂含:2×multiplex PCR premix和无菌水。
6.一种如权利要求1-5中任一项所述的人血浆PTEN基因甲基化的检测试剂盒在评估PTEN基因在血浆肿瘤循环DNA中的含量中的应用。
7.一种使用如权利要求1-5中任一项所述的检测试剂盒进行人血浆PTEN基因甲基化检测的方法,其特征在于,
A、将采集的血样进行预处理;
B、将预处理得到的血浆采用磁珠法进行提取获得血浆游离DNA;
C、采用亚硫酸氢盐法将血浆游离DNA进行化学修饰,再进行CT转换处理后重新提取DNA;
D、以步骤C处理后获得的DNA样本为扩增模板,分别以所述甲基化特异引物对和非甲基化特异引物对进行荧光定量MSP检测;
E、以标准品血浆DNA的扩增结果制定外标准曲线,对待测样本进行定量结果分析。
8.根据权利要求7所述的进行人血浆PTEN基因甲基化检测的方法,其特征在于,步骤C中,所述CT转换处理具体包括:
C1、向CT Conversion粉剂中加入水、M-Dilution Buffer和M-Dissolving Buffer,室温振荡充分溶解和混匀,配制得CT Conversion试剂;
C2、将CT Conversion试剂和血浆游离DNA加入PCR管中,振荡、离心后,进行CT转换;CT转换的PCR条件为:98℃10min,64℃2.5h,20℃;
C3、吸取M-Binding buffer于IC柱中,然后将步骤C2获得的CT转换反应产物加入IC柱中,混匀,离心,去废液;
C4、吸取M-Wash Buffer加入IC柱中,离心,弃废液;
C5、吸取M-Desulphonation Buffer加入IC柱中,避光,室温静置20min,离心;
C6、吸取M-Wash Buffer加入IC柱中,离心,弃废液;
C7、再吸取M-Wash Buffer加入IC柱中,离心,然后将IC柱室温干燥;
C8、将IC柱放入水中室温静置,离心,收集,即得重新提取的DNA。
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