[发明专利]对肽进行复用MS-3分析的方法

权利要求书

1.一种用于目标肽的质谱分析的方法，包括：

(a)接收或计算具有式[M+2A]²⁺的目标前体离子种类的前体质荷比值(m/z)_p，其中M表示中性目标肽分子的组成并且每种加合物A是质子或碱金属阳离子；

(b)将样品引入质谱仪的离子源中；

(c)由所述离子源从所述样品中生成离子，其中所述离子源通过使所述样品中的所述目标肽电离而生成所述目标前体离子种类；

(d)纯化和碎裂包含所述(m/z)_p的离子，因而从其中生成多个第一代碎片离子种类，所述第一代碎片离子种类是MS-2种类；

(e)共纯化和共碎裂多个所生成MS-2种类的子集，因而从其中生成多个第二代碎片离子种类，所述第二代碎片离子种类是MS-3种类，其中共纯化和共碎裂的MS-2种类中的每一种包含相应的大于(m/z)_p的碎片质荷比值(m/z)_f；

(f)质谱分析所述MS-3种类并选择多个所生成MS-3种类的子集，其中所选MS-3种类中的每一种均包含相应的满足质荷比选择标准的第二代碎片质荷比值(m/z)_g；以及

(g)从对应于所选MS-3种类的质谱强度的总和，确定所述样品中所述目标肽的量。

2.如权利要求1中所述的方法，其中当(m/z)_g小于(m/z)_p，则MS-3种类质荷比值(m/z)_g满足所述质荷比选择标准。

3.如权利要求1中所述的方法，其中当(m/z)_g小于共纯化和共碎裂的所有所述MS-2种类中的最低m/z值，则MS-3种类质荷比值(m/z)_g满足所述质荷比选择标准。

4.如权利要求1中所述的方法，其中选择多个所生成MS-3种类的子集包括仅选择是y型离子种类的MS-3种类。

5.如权利要求1中所述的方法，其中选择多个所生成MS-3种类的子集包括仅选择具有随时间表现出彼此正相关的质谱峰强度的MS-3种类。

6.如权利要求4中所述的方法，其中选择多个所生成MS-3种类的子集包括选择满足所述质荷比选择标准的n₂个最丰富的y型MS-3种类，其中n₂是预定的正整数。

7.如权利要求1中所述的方法，其中共碎裂多个所生成MS-2种类的子集包括通过共振激发型碰撞诱导的解离并且以其质荷比的相反顺序依次碎裂所述子集的所选MS-2种类。

8.如权利要求1中所述的方法，还包括在数据库条目中记录多个所生成MS-3种类的所选子集的所述离子种类的m/z值。

9.如权利要求1中所述的方法，还包括，在生成多个MS-2种类的步骤(d)之后并且在共纯化和共碎裂多个所生成MS-2种类的子集的步骤(e)之前：

质谱分析多个MS-2种类；以及

选择多个所生成MS-2种类的子集，其中所选MS-2种类中的每一种是y型离子种类。

10.如权利要求9中所述的方法，其中选择多个所生成MS-2种类的子集包括选择n₁个最丰富的y型MS-2种类，对于所述n₁个最丰富的y型MS-2种类，(m/z)_f大于(m/z)_p，其中n₁是预定的正整数。