[发明专利]一种乳腺癌相关的激酶变异的检测panel及其应用

说明书

本发明公开了一种乳腺癌相关的激酶变异的检测panel，所述检测panel包括受体酪氨酸激酶(RTK)、磷脂酰肌醇3‑激酶(PI3K)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)相关基因及其下游基因的外显子区域和部分内含子区域，本发明还公开了含有检测panel的试剂盒。通过本发明的检测panel，可以更高效地检测出对诊断、治疗有指导意义的基因变异，同时，对临床的诊断和发现靶向治疗的靶点具有重要指导意义，也可以降低患者基因检测的成本。

技术领域

本发明属于基因检测技术领域，具体涉及一种乳腺癌相关的激酶变异的检测panel及其应用。

背景技术

癌症是当今世界引起死亡与残疾的首要原因。每种肿瘤都包括遗传性(胚系)和肿瘤特异性(体细胞)变异。在过去的十年中，高通量测序和生物信息学技术巨大的进步，大量胚系和体细胞基因的突变信息被收集。大量临床实践已经证明，将癌症患者身上出现突变的特定蛋白作为靶点的治疗是有效的。为了实现精准医学的目标，即将正确的药物用于正确的患者，许多实验室已经开始在癌症基因检测中应用二代测序技术。

乳腺癌的发生发展与许多信号通路异常密切相关，其中的关键分子一直是药物研发的热点。其中，受体酪氨酸激酶(receptor tyrosine kinases，RTKs)、磷脂酰肌醇3-激酶(phosphoinositide 3-kinase，PI3K)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated proteinkinase，MAP K)以及他们下游信号分子，因其在乳腺癌中的重要作用近年来受到越来越多的关注。如今越来越多的激酶的基因变异被证实与包括乳腺癌在内的各种形式的肿瘤相关，据研究报导，PIK3CA，AKT，以及PTEN的突变能加剧乳癌晚期病人的治疗难度；而BRAF的突变也使黑色瘤的抗药性增强。因此，对于突变的检测对靶向激酶药物被在癌症中治疗效果评估，具有重大的应用价值。然而，目前临床应用中仅是针对单个或者几个激酶基因突变点的预测，这并不能满足实际临床检测诊断的需求。

发明内容

本发明为了解决上述技术问题，本发明选取了乳腺癌中常见出现变异的激酶基因，包括受体酪氨酸激酶、磷脂酰肌醇3-激酶、丝裂原活化蛋白激酶等以及他们下游信号分子共111个基因，并基于二代测序技术，利用生物素探针杂交法富集了所述111个基因的重要外显子区域与部分内含子区域，并进行高深度测序，从而精准检测其中与乳腺癌有明确临床相关性的激酶基因突变、拷贝数变异等事件，并将该多基因筛选列表做成探针panel及其应用。

第一方面，本发明提供了一种乳腺癌相关的激酶变异的检测panel，其特征在于，所述检测panel包括受体酪氨酸激酶、磷脂酰肌醇3-激酶、丝裂原活化蛋白激酶相关以及他们下游的信号分子的外显子区域和部分内含子区域。

进一步地，所述的信号分子包括以下基因如下表所示表1检测panel

第二方面，本发明还提供了表1所述的检测panel在制备检测乳腺癌的产品中的应用。

进一步地，所述产品为检测装置或检测试剂盒。

进一步地，所述试剂盒包括检测探针，所述检测探针针对检测panel中基因的外显子区域和部分内含子区域。

本发明的检测panel可以通过以下两方面应用：

第一：对样本进行全基因组或全外显子测序，分析后得到所有基因的突变情况，找到本发明检测panel的基因，来结合临床进行下一步分析。

第二，对本发明所列基因构建探针，针对性地只测序样本的本发明所列基因，分析得到突变情况后与临床结合进行下一步诊断，同时通过检测本发明所列的基因的异常情况，可以用来作为临床诊断的参考，帮助医生对患者的癌症发展情况有更深层的认识，有助于治疗方案的设计，使病人了解自身基因变异的情况。

本发明的有益效果：