[发明专利]SNP标志物在胰腺癌预后中的应用

说明书

本发明公开了SNP标志物在胰腺癌预后中的应用，通过对IOERT‑LAPC的样本进行测序，本发明首次发现了rs1026654与IOERT‑LAPC患者的生存期相关，进一步使用sanger测序在IOERT‑LAPC患者中进行验证，发现当rs1026654的基因型为AA时，患者的预后较好，当rs1026654基因型为AG或GG时，预后较差，提示可以通过检测rs1026654的基因型判断IOERT‑LAPC患者的预后。

技术领域

本发明属于生物医药领域，涉及SNP标志物胰腺癌预后中的应用，具体的涉及SNP为rs1026654。

背景技术

胰腺癌是一种恶性程度高的消化道肿瘤，在常见肿瘤中占第13位，因肿瘤导致死亡的主要原因中占第四位，其死亡率几乎等于发病率(Oberstein P E,OliveKP.Pancreatic cancer:why is it so hard to treat？[J].Therap Adv Gastroenterol,2013,6(4):321-337.)。胰腺癌的高死亡率在发达国家呈现明显趋势，在欧盟28个国家中胰腺癌将超过乳腺癌成为第三大致死原因。近年来由于发展中国家人口逐步适应发达国家的生活方式，比如吸烟、高热量食物、较少的体育锻炼，胰腺癌死亡率也逐渐上升。手术根治虽然是最有效的治疗措施，但只适合20％的患者(Siegel R L,Miller K D,Jemal A.Cancerstatistics,2015[J].CA Cancer JClin,2015,65(1):5-29.)。吉西他滨是目前治疗胰腺癌的一线用药，缓解率却低于12％。

胰腺癌起病隐匿、早期诊断困难、远处转移、化疗抵抗，大多数胰腺癌患者发现时已处于中晚期，失去根治的机会，由于胰腺癌具有快速增殖能力和高度侵袭转移倾向，发病机制复杂和不确定，目前仍缺乏有效的系统治疗手段。

术中电子线放疗(intraoperative electron radiotherapy，IOERT)是在手术中对不能切除的肿瘤或切除肿瘤后的瘤床、残存肿瘤和淋巴引流区给予一次大剂量照射。由于术中定位精确、病灶受量佳、正常组织保护好及治疗时间短等优势，可用于胰腺癌的治疗中。

本申请拟通过检测IOERT治疗的胰腺癌患者的基因组，筛选与IOERT治疗生存期相关的基因型，为胰腺癌的诊断以及治疗和预后提供分子基础。

发明内容

为了弥补现有技术的不足，本发明的目的在于提供一种用于判断胰腺癌预后的SNP标志物，通过检测SNP基因型来判断胰腺癌患者的预后。

为了实现上述目的，本发明采用了如下技术方案：

本发明提供了检测样本中SNP标志物的试剂在制备判断胰腺癌预后的产品中的应用，所述SNP为rs1026654。

进一步，所述胰腺癌为经术中电子线放疗治疗的胰腺癌。

进一步，所述胰腺癌为经术中电子线放疗治疗的局部晚期胰腺癌。

进一步，当rs1026654的基因型为AA时，患者的预后较好，当基因型为AG或GG时，预后较差。

进一步，检测样本中SNP标志物的试剂包括通过直接测序、单碱基延伸、等位基因特异性探针杂交、等位基因特异性引物延伸、等位基因特异性扩增(allele-specific PCR，AS-PCR))、等位基因特异性核苷酸掺入、5'核酸酶消化、分子信标测定、寡核苷酸连接测定、大小分析和单链构象多态性(SSCP)方法检测rs1026654基因型的试剂。