[发明专利]RNase作用底物和RNase污染检测方法及应用在审
申请号: | 201911154378.6 | 申请日: | 2019-11-22 |
公开(公告)号: | CN110714052A | 公开(公告)日: | 2020-01-21 |
发明(设计)人: | 赵斯斯;张中娜;王雅欣 | 申请(专利权)人: | 生工生物工程(上海)股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/44 | 分类号: | C12Q1/44;G01N21/64 |
代理公司: | 11463 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) | 代理人: | 徐乐 |
地址: | 201600 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 作用底物 荧光探针 修饰 分子生物学领域 待检测样本 实验室环境 淬灭基团 茎环结构 实验物料 污染检测 荧光基团 单链RNA 不对称 污染量 环部 碱基 茎部 质控 应用 监控 检测 申请 污染 | ||
1.一种RNase作用底物,其特征在于,所述RNase作用底物为荧光探针,该荧光探针具有茎环结构,环部的序列长度为3-8bp,茎部的序列长度为3-9bp,5’端和3’端具有0-2bp的不对称碱基;
所述荧光探针的5’端修饰有荧光基团,3’端修饰有淬灭基团。
2.根据权利要求1所述的RNase作用底物,其特征在于,所述RNase作用底物的序列为如下SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.3任一种:
5’-GCUACCUCAUGGUAGC-3’(SEQ ID NO.1),其中,环部序列为5’-UCAU-3’;
5’-GCUACCUCAUAGUAGC-3’(SEQ ID NO.2),其中,环部序列为5’-CUCAUA-3’;
5’-UCUCACUGUAUUGAGA-3’(SEQ ID NO.3),其中,环部序列为5’-CUGUAU-3’。
3.根据权利要求1所述的RNase作用底物,其特征在于,所述荧光基团包括FAM、HEX、VIC、ROX或Cy5,优选为FAM;
优选地,所述淬灭基团包括BHQ-0、BHQ-1、BHQ-2或BHQ-3,优选为BHQ-1。
4.根据权利要求1-3任一项所述的RNase作用底物在RNase检测或制备RNase检测的产品中的应用。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述RNase检测为RNase活力检测或RNase污染检测;
优选地,所述产品包括试剂或试剂盒。
6.一种RNase污染检测方法,其特征在于,将权利要求1-3任一项所述的RNase作用底物加入待检测样本进行反应,检测反应物中的荧光信号值,根据荧光信号值得到待检测样本中RNase的含量。
7.根据权利要求6所述的RNase污染检测方法,其特征在于,检测反应物中的荧光信号值的方法包括如下a)、b)或c):
a)荧光定量PCR检测方法检测;
b)RNase作用底物和待检测样本混匀后35-39℃反应25-35min后,微量荧光分光光度计检测;
c)RNase作用底物和待检测样本混匀后35-39℃反应25-35min后,特定光照肉眼可视观察检测。
8.根据权利要求6所述的RNase污染检测方法,其特征在于,还包括构建标准曲线的步骤,将待检测样本的荧光信号值与标准曲线进行比对,得到待检测样本中RNase的含量;
所述标准曲线包括RNase标准品的浓度与RNase标准品荧光信号值的关系。
9.根据权利要求6-8任一项所述的RNase污染检测方法,其特征在于,RNase作用底物的工作浓度为0.1-5μmol/L;
优选地,所述RNase污染检测方法还包括负对照的荧光信号值检测,负对照为无酶水;
优选地,检测标准为待检测样品的荧光信号值比负对照的荧光信号值高2倍以上判定为待检测样品中含有RNase污染。
10.权利要求6-9任一项所述的RNase污染检测方法在比较多个待检测样本中RNase含量或相对含量的应用。
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