[发明专利]检测厌氧氨氧化菌的方法在审
申请号: | 201911165998.X | 申请日: | 2019-11-25 |
公开(公告)号: | CN110923340A | 公开(公告)日: | 2020-03-27 |
发明(设计)人: | 卢紫欣;陈刚新;王国安;吴从从;李魁晓 | 申请(专利权)人: | 北京城市排水集团有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6806;C12Q1/686;C12Q1/04 |
代理公司: | 北京思创大成知识产权代理有限公司 11614 | 代理人: | 高爽 |
地址: | 100044 北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 厌氧氨 氧化 方法 | ||
1.一种检测厌氧氨氧化菌的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:
ⅰ)构建含有厌氧氨氧化菌的DNA片段的质粒;
ⅱ)将所述质粒导入感受态细胞中,并且对所述感受态细胞进行扩繁,提取扩繁后的感受态细胞中的质粒,对该质粒进行梯度稀释,获得不同浓度的质粒;
ⅲ)从污染物中提取厌氧氨氧化菌,提取该厌氧氨氧化菌的DNA;
ⅳ)同时对步骤ⅱ)获得的不同浓度的质粒和步骤ⅲ)获得的DNA进行荧光定量PCR,获得步骤ⅱ)获得的不同浓度的质粒分别对应的荧光强度和步骤ⅲ)获得的DNA对应的荧光强度;
ⅴ)根据步骤ⅳ)获得的不同浓度的质粒以及每个浓度的质粒对应的荧光强度,绘制标准曲线;
ⅵ)根据所述标准曲线和步骤ⅴ)获得的DNA对应的荧光强度,计算所述污染物中厌氧氨氧化菌的含量。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤ⅰ)包括以下步骤:
a)获取厌氧氨氧化菌;
b)提取所述厌氧氨氧化菌的DNA,之后进行PCR,获得厌氧氨氧化菌的DNA片段;
c)将所述DNA片段导入载体中,构建含有厌氧氨氧化菌的DNA片段的质粒。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述DNA片段由如SEQ ID NO:1所示的上游引物和如SEQ ID NO:2所示的下游引物扩增制得。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,在步骤ⅳ)中,所述荧光定量PCR的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;所述荧光定量PCR的下游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO:2所示。
5.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述感受态细胞为大肠杆菌DH5α。
6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述载体为pGEMZ载体。
7.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述标准曲线的检出限为108~1013拷贝数/μl。
8.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述污染物为污水或污泥。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,在步骤ⅲ)中,所述从污染物中提取厌氧氨氧化菌包括以下步骤:
将污水冷冻成固态,之后从固态升华成气态,从升华后的剩余物质中提取所述厌氧氨氧化菌。
10.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述将污水冷冻成固态,之后从固态升华成气态,从升华后的剩余物质中提取所述厌氧氨氧化菌包括以下步骤:
将污水冷冻成固态,之后在-20~-56℃的条件下,真空干燥,得到剩余物质,从所述剩余物质中提取所述厌氧氨氧化菌。
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