[发明专利]一种可视化编辑upset韦恩图的生成方法及系统在审

专利信息
申请号: 201911191849.0 申请日: 2019-11-28
公开(公告)号: CN110970092A 公开(公告)日: 2020-04-07
发明(设计)人: 夏昊强;周煌凯;高川;陶勇;罗玥;程祖福;邢燕;曾川川 申请(专利权)人: 广州基迪奥生物科技有限公司
主分类号: G16B45/00 分类号: G16B45/00
代理公司: 广州容大专利代理事务所(普通合伙) 44326 代理人: 刘新年
地址: 510000 广东省广州市广州国*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 可视化 编辑 upset 韦恩图 生成 方法 系统
【说明书】:

发明涉及高通量测序生物信息领域,具体涉及一种可视化编辑upset韦恩图的生成方法及系统。通过获取绘制upset韦恩图实时请求数据;对获取到的实时请求数据进行解析处理;根据解析处理得到的数据,生成可视化编辑upset韦恩图。可以实现通过简单的任务编号、上传需要绘制upset韦恩图的数据文件及参数设置这些简单的操作,实现自动绘图,大大解决了用户画图难的困扰,提高了工作效率。再者,可实现用户在查看结果时可以通过点击柱状图柱子即可查看对应的结果信息,也可以直接进行相应参数的修改,图片结果会实时得到修改,直到用户满意便可进行图片下载保存,这样的结果可编辑性强、图形美观。

技术领域

本发明涉及高通量测序生物信息领域,具体涉及一种可视化编辑upset韦恩图的生成方法及系统。

背景技术

韦恩图(Venn diagram),在1880年由英国哲学家和数学家John Venn提出。在高通量测序数据分析中广泛应用,常被用于展示不同样本间共有的或特有的基因。常见的韦恩图一般用于处理5个以下分组,,当处理组增加到5个以上,虽然可以绘制出不同形式的韦恩图。但是,结果可读性很差,用户很难从图中解读到想要的信息。因此,有了upsetR包用来画韦恩图解读样本处理组多的情况。然而,该工具绘制出的韦恩图是静态的,具有无法实时编辑、时效性差的弊端。

发明内容

针对无法实时编辑、时效性差的技术问题,本发明提供一种可视化编辑upset韦恩图的生成方法、系统、平台及存储介质,实现可实时编辑,时效性好的目的。

本发明具体通过以下技术方案实现:

一种可视化编辑upset韦恩图的生成方法,所述的方法,具体包括如下步骤:

获取绘制upset韦恩图实时请求数据;

对获取到的实时请求数据进行解析处理;

根据解析处理得到的数据,生成可视化编辑upset韦恩图。

进一步地,所述的实时请求数据包括:用户命名的任务编号、绘图数据文件和是否去重复性的参数设置信息。

进一步地,于步骤获取绘制upset韦恩图实时请求数据中,还包括如下步骤:

判断是否去重复性的参数设置。

进一步地,于步骤对获取到的实时请求数据进行解析处理中,还包括如下步骤:

通过解析处理得到的任务编号和绘图参数设置信息生成配置文件和绘图任务执行命令。

进一步地,于步骤根据解析处理得到的数据,生成可视化编辑upset韦恩图中,还包括如下步骤:

将解析处理得到的数据统计分类,并对数据的集合关系进行计算,生成相对应的结果文件;

将结果文件实时存储于云端,并对存储状态实时提醒。

进一步地,于步骤根据解析处理得到的数据,生成可视化编辑upset韦恩图之后,还包括如下步骤:

对生成可视化编辑upset韦恩图进行实时展示和绘图交互;

所述的实时展示和绘图交互具体包括对生成的upset韦恩图进行预览、修改和下载。

为实现上述目的,本发明还提供一种可视化编辑upset韦恩图的生成系统,所述的系统具体包括:

获取单元,用于获取绘制upset韦恩图实时请求数据;

解析处理单元,用于对获取到的实时请求数据进行解析处理;

生成单元,用于根据解析处理得到的数据,生成可视化编辑upset韦恩图。

进一步地,所述的系统还包括:

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