[发明专利]TaNCED1基因B基因组T/G SNP标记与应用

说明书

本发明公开了TaNCED1基因B基因组T/G SNP标记与应用。NCED基因是ABA生物合成过程中的关键限速酶。在植物的抗旱过程中发挥着重要的调控作用，在TaNCED1基因B基因组441bp处发现T/G等位变异，开发了KASP标记，并对364份来自不同地区的小麦品种进行了检测，其中抗旱品种74个，占总数的20.33%；水地种植的品种290个，占总数的79.67%。分析发现，有234个品种是T类型，占总数的64.3%，其中具有抗旱性小麦品种29个，占该类型的12.39%；112个品种是G类型，占总数的30.8%，其中具有抗旱性小麦品种41个，占该类型的36.61%；另外有18个品种属于未知类型。在G类型中，如耐盐品种3D232、农大399和德抗961，抗旱品种和尚头、鲁麦11和临旱2号多属于此类，该位点可以作为筛选抗旱和耐盐材料的标记。

技术领域

本发明属于小麦遗传学领域，具体涉及TaNCED1基因B基因组T/G SNP标记与应用。

背景技术

在ABA的生物合成途径中，9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶（NCED）是关键的限速酶，能够调控ABA的合成速度。2012年本课题组成功克隆了小麦NCED1基因的全长，并将其命名为TaNCED1，GenBank登录号为JQ772528.1，该基因为单拷贝，长度为1 848 bp，无内含子。研究表明，在小麦中TaNCED1基因对脱水、盐、冷和ABA胁迫均产生不同程度的响应；过表达TaNCED1的转基因烟草抗旱性显著提高。

为了研究小麦中TaNCED1基因表达和ABA积累的关系，我们分析了8个抗旱性不同的小麦品种在干旱胁迫和复水过程中TaNCED1基因表达和ABA积累的动态变化过程，结果表明品种间TaNCED1的表达水平存在明显差异，且TaNCED1对ABA影响程度存在较明显的差异。

发明内容

为明确不同材料中TaNCED1基因对ABA影响不同的原因，本专利研究进一步分析了17个抗旱性不同材料的TaNCED1基因序列的差异，发现在B基因组存在T/G变异位点。为了研究这个变异位点在小麦种质中的分布情况，探讨TaNCED1不同的变异类型与小麦品种的抗旱性关系，针对这个变异位点，本专利开发了KASP标记，并对小麦品种进行检测，以期为小麦分子辅助育种提供宝贵资源和有效的分子标记。

本发明是通过以下技术方案实现的：

本发明提供了一个TaNCED1基因B基因组SNP标记，在TaNCED1基因B基因组441bp处具有等位变异T/G 。

所述SNP标记的两条正向特异性引物和一条反向通用引物DNA序列如SEQ IDNo.1-3所示。

所述SNP标记具有G变异的小麦品种抗旱性强。

所述SNP标记具有G变异的小麦品种水分胁迫耐受性强或耐盐性强。

该标记可以在筛选抗旱耐盐材料中应用。

本发明的有益效果是：