[发明专利]一种基于RPA方法快速检测非洲猪瘟病毒的引物组和探针、试剂盒以及检测方法在审
申请号: | 201911245018.7 | 申请日: | 2019-12-06 |
公开(公告)号: | CN110760619A | 公开(公告)日: | 2020-02-07 |
发明(设计)人: | 杨鑫;翟亚如;王红宁;马鹏;李豪;崔鹏飞;张兰 | 申请(专利权)人: | 四川大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 51224 成都顶峰专利事务所(普通合伙) | 代理人: | 王霞 |
地址: | 610000 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 引物组 探针 检测 非洲猪瘟病毒 试剂盒 可视化检测 反向引物 合成引物 快速检测 扩增产物 仪器设备 正向引物 猪瘟 精细 资金 | ||
1.一种基于RPA方法快速检测非洲猪瘟病毒的引物组和探针,其特征在于:包括引物组和探针Probe;所述引物组包括正向引物RPA-F和反向引物RPA-R;
正向引物RPA-F序列:
5’-ATTCTRATGATAAATGGCACTCCACTTCCGGC-3’;
反向引物RPA-R序列:
5’-CCTACTCGTCAAACGTTTGTTCTGGCCCTAGCTT-3’;
探针Probe的核苷酸序列由两部分连接而成,分别为第一部分和第二部分,其中第一部分的核苷酸序列为:
第一部分的序列:
5’-AATGAWCAAACGAGTCCTCCCGCCTCAGGAA-3’;
第二部分的序列:
5’-AACAAGTGAAACACCTAA-3’;
第一部分的5’端连接羧基荧光素,第二部分的3’端连接磷酸,第一部分的3’端和第二部分的5’端之间通过四氢呋喃连接。
2.根据权利要求1所述的一种基于RPA方法快速检测非洲猪瘟病毒的引物组和探针,其特征在于:反向引物RPA-R序列的5’端用生物素修饰;引物组和探针Probe的总扩增产物大小为267bp。
3.一种基于RPA方法快速检测非洲猪瘟病毒的试剂盒,其特征在于:包括权利要求1或2所述的引物组和探针。
4.一种基于RPA方法快速检测非洲猪瘟病毒的检测方法,其特征在于:包括步骤:
合成以下引物组和探针;
正向引物RPA-F序列:
5’-ATTCTRATGATAAATGGCACTCCACTTCCGGC-3’;
反向引物RPA-R序列:
5’-CCTACTCGTCAAACGTTTGTTCTGGCCCTAGCTT-3’;
探针Probe序列:
5’-FAM-AATGAWCAAACGAGTCCTCCCGCCTCAGGAA[THF]AACAAGTGAAACACCTAA-P-3’;
RPA-LFD检测方法的建立;
将正向引物、反向引物和探针加入到离心管中,再加入无引物再水合缓冲液,振荡并离心;将模板和灭菌水混匀后,放入上述离心管中,振荡并离心,此时的溶液为再水合溶液;将再水合溶液转移至反应微球中,吹打混匀直到整个微球重悬,然后加入醋酸镁,充分混匀,进行RPA-LFD反应恒温孵育后,得到反应产物;
将反应产物与PBST电泳缓冲液混合后得到稀释样本,将稀释样本转移至侧向流纸条的样本垫,然后将所述样本垫放入电泳缓冲液中,观察结果;若所述样本垫出现两条带为阳性;若所述样本垫只在对照线出有一条带为阴性。
5.根据权利要求4所述的一种基于RPA方法快速检测非洲猪瘟病毒的检测方法,其特征在于:所述检测方法的反应总体系为50μL;其中浓度为10μM的正向引物RPA-F为2.1μL,浓度为10μM的反向引物RPA-R为2.1μL,浓度为10μM的探针Probe为0.6μL,无引物再水合缓冲液为29.5μL,模板1μL,无菌水为12.2μL,浓度为280mM的醋酸镁为2.5μL。
6.根据权利要求5所述的一种基于RPA方法快速检测非洲猪瘟病毒的检测方法,其特征在于:所述恒温孵育的时间为15min。
7.根据权利要求6所述的一种基于RPA方法快速检测非洲猪瘟病毒的检测方法,其特征在于:所述恒温孵育的温度为36℃。
8.根据权利要求7所述的一种基于RPA方法快速检测非洲猪瘟病毒的检测方法,其特征在于:所述稀释样本是通过将2μL的反应产物与98μL的PBST电泳缓冲液混合得到的。
9.根据权利要求8所述的一种基于RPA方法快速检测非洲猪瘟病毒的检测方法,其特征在于:所述样本垫上的稀释样本体积为10μL。
10.根据权利要求9所述的一种基于RPA方法快速检测非洲猪瘟病毒的检测方法,其特征在于:放入样本垫的电泳缓冲液的体积为200μL。
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