[发明专利]头颈部鳞癌诊治标志物

说明书

本发明提供了一种头颈部鳞癌诊治标志物。本发明利用生物信息学研究表明包括RP11.863P13.3在内的13种LncRNA作为生物标志物可有效诊断头颈部鳞癌，AUC值高达0.983。根据本发明的研究成果可制备诊断头颈部鳞癌的诊断试剂盒，该试剂盒在具有较好的市场前景。

技术领域

本发明属于生物医学领域，涉及头颈部鳞癌诊治标志物。

背景技术

头颈部鳞癌(Squamous Cell Carcinoma of Head and Neck，SCCHN)是世界范围内第6大常见肿瘤。头颈部鳞癌包括喉癌、口腔癌、鼻咽癌、下咽癌等。2010年，美国疾病控制中心的统计结果表明，全球每年约50万人患头颈鳞癌，死亡人数约为12000人。近年来，虽然包括手术、放化疗等各种治疗方法均取得了巨大进展，但由于技术水平等诸多可观因素的限制，很多肿瘤在发现时已发展至中晚期，治疗手段局限，治疗效果及预后较差，生存率一直较低，头颈部鳞癌的5年生存率并没有明显提高，仍在60％左右。而早期肿瘤体积小，较少转移，如适时进行治疗可有效的控制肿瘤发展，治愈率可达83％，因此积极开展肿瘤的早期发现、诊断和早期治疗的研究，对于癌症的预防和控制有着重要的意义。

人体中编码蛋白质的基因大约有2-3万个，仅占人类基因组的2％，其余98％不编码蛋白质的基因组DNA最初被认为是没有功能的，是生物体中的垃圾，通常被称为“垃圾DNA”。

但目前的研究表明，这些垃圾DNA大多可转录产生非编码RNA(non-coding RNA，ncRNA)。根据成熟转录本大小的不同，ncRNA可分为小分子ncRNA(如siRNA，miRNA，piRNA等)，中等长度ncRNA(70-200nt)和长ncRNA(long ncRNA，LncRNA，200nt)。

目前，ncRNA领域研究较多的是小分子ncRNA，而对LncRNA的研究还处于起步阶段。由于序列内部存在过多的终止密码子，LncRNA不能被翻译成蛋白质，他们通常是以RNA转录本的形式行使其生物学功能，如发育过程中的细胞分化、细胞增殖、细胞凋亡和类固醇代谢等。

最近的研究发现LncRNA与肺癌、非霍杰金淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤和慢性淋巴细胞白血病等肿瘤疾病有关。这表明LncRNA与细胞的癌变有着极为密切的联系，LncRNA在细胞增殖、分化和癌变中发挥着重要的作用。目前，已经克隆的人类lncRNAs基因已超过4万多个，但绝大部分lncRNA的功能未知。

本申请的目的是寻找可以作为头颈部鳞癌诊断的lncRNA标志物，开拓头颈部鳞癌早期诊断的新方法。

发明内容

为了克服现有技术的不足，本发明的目的在于提供一种用于诊断头颈部鳞癌的长链非编码RNA标志物。本发明生物信息学证明RP11.863P13.3、IL12A.AS1、RP11.159F24.6、LINC00941、FOXCUT、RNF144A.AS1、RP11.218E20.3、HCG22、HAGLROS、LINC01615、RP11.351J23.1、AC024592.9、MIR9.3HG组合可用于诊断头颈部鳞癌患者，准确率高达98％，因此可以将以上长链非编码RNA标志物作为诊断头颈部鳞癌的标志物。

为了实验上述目的，本发明采用了如下技术方案：

根据本发明的一个方面，本发明提供了一种头颈部鳞癌诊治标志物，所述标志物包括RP11.863P13.3。

进一步，所述标志物还包括以下非编码RNA中的一个或多个：IL12A.AS1、RP11.159F24.6、LINC00941、FOXCUT、RNF144A.AS1、RP11.218E20.3、HCG22、HAGLROS、LINC01615、RP11.351J23.1、AC024592.9、MIR9.3HG。