[发明专利]基于数字PCR无创产前检测胎儿21、18、13三体综合征的方法及试剂盒在审
申请号: | 201911265644.2 | 申请日: | 2019-12-11 |
公开(公告)号: | CN110951857A | 公开(公告)日: | 2020-04-03 |
发明(设计)人: | 梁军;景奉香;吴东平 | 申请(专利权)人: | 上海小海龟科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 上海晨皓知识产权代理事务所(普通合伙) 31260 | 代理人: | 成丽杰 |
地址: | 200439 上海市宝山区一*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 数字 pcr 产前 检测 胎儿 21 18 13 综合征 方法 试剂盒 | ||
1.一种基于数字PCR无创产前检测胎儿21、18、13三体综合征的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)从待测样本孕妇外周血中获得游离DNA,作为待测基因组DNA;
(2)选择人类第21号、第18号和第13号染色体的检测位点,分别设计用于扩增和检测目标染色体的特异性引物和Taqman探针;选择人类第8号、第2号染色体的检测位点,分别设计用于扩增和检测参照染色体的特异性引物和Taqman探针;
其中,所述用于扩增和检测目标染色体的特异性引物和Taqman探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:36所示;所述用于扩增和检测参照染色体的特异性引物和Taqman探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:37~SEQ ID NO:48所示;
(3)配制数字PCR扩增反应体系,以步骤(1)所述的待测基因组DNA为模板,利用步骤(2)所述的特异性引物和Taqman探针进行数字PCR扩增和检测;
(4)根据数字PCR的荧光信号,分别得到待测样本的第21号染色体的拷贝数a21、第18号染色体的拷贝数a18、第13号染色体的拷贝数a13和参照染色体的拷贝数b;
其中,参照染色体的拷贝数b为待测样本的第2号染色体的拷贝数b2和第8号染色体的拷贝数b8的平均值;
(5)分别计算待测样本第21号染色体的拷贝数a21、第18号染色体的拷贝数a18、第13号染色体的拷贝数a13占该样本参照染色体的拷贝数b的百分比y21、y18和y13;
(6)分别计算待测样本的第21号、第18号和第13号染色体的Z-score:(Z-score)21=(y21-m)/σm;(Z-score)18=(y18-n)/σn;(Z-score)13=(y13-p)/σp;其中,
m为三体综合征阴性样本的第21号染色体的拷贝数a21占该样本参照染色体的拷贝数b的百分比的平均值;
n为三体综合征阴性样本的第18号染色体的拷贝数a18占该样本参照染色体的拷贝数b的百分比的平均值;
p为三体综合征阴性样本的第13号染色体的拷贝数a13占该样本参照染色体的拷贝数b的百分比的平均值;
σm为三体综合征阴性样本的第21号染色体的拷贝数a21占该样本参照染色体的拷贝数b的百分比的标准差;
σn为三体综合征阴性样本的第18号染色体的拷贝数a18占该样本参照染色体的拷贝数b的百分比的标准差;
σp为三体综合征阴性样本的第13号染色体的拷贝数a13占该样本参照染色体的拷贝数b的百分比的标准差;
(7)根据待测样本的第21号、第18号和第13号染色体的Z-score值分别判断待测样本的第21号染色体、第18号染色体或第13号染色体的数目是否存在异常。
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