[发明专利]一种厦门链霉菌及其生物合成苯并吡喃类和4-氢喹啉类化合物的方法有效
申请号: | 201911267300.5 | 申请日: | 2019-12-11 |
公开(公告)号: | CN112940999B | 公开(公告)日: | 2022-08-23 |
发明(设计)人: | 徐岷涓;徐俊;步绪亮;贺贝贝;翁静怡 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12N1/21 | 分类号: | C12N1/21;C12N15/76;C12P17/06;C12P17/12;C12R1/465 |
代理公司: | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 | 代理人: | 胡晶 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 厦门 霉菌 及其 生物 合成 吡喃类 喹啉 化合物 方法 | ||
1.一种厦门链霉菌,其特征在于,通过将质粒pIB1884-xim2转移至菌株StreptomycesxiamenensisΔximΔika中构建得到;
所述质粒pIB1884-xim2的序列如SEQ ID NO.1所示;
所述菌株Streptomyces xiamenensisΔximΔika的构建方法包括以下步骤:
A1、以厦门链霉菌基因组DNA为模板,分别PCR扩增厦门霉素生物合成基因簇(xim)上下游的片段,然后通过酶切连接克隆至pJTU1278的XbaI/HindIII酶切位点,获得过渡质粒;然后以pIB139为模板,PCR扩增编码阿泊拉霉素的抗性基因aac(3)IV,克隆至前述过渡质粒的KpnI酶切位点从而获得基因敲除质粒pDxim,将质粒pDxim导入野生型厦门链霉菌318中,筛选得到基因簇xim被同框敲除菌株Δxim;
A2、以厦门链霉菌基因组DNA为模板,分别PCR扩增多环稠合大环内酰胺化合物合成基因簇(ika)上下游的片段以及一段包含attB位点的序列,然后隆至pJTU1278的XbaI/HindIII酶切位点获得过渡质粒;然后将编码阿泊拉霉素的抗性基因aac(3)IV克隆至该过渡质粒的KpnI酶切位点,从而获得基因敲除质粒pKIattB;
A3、将质粒pKIattB通过接合转移导入步骤A1得到的菌株Δxim中,筛选获得基因簇ika被attB替换的突变菌株,即得菌株Streptomyces xiamenensisΔximΔika。
2.根据权利要求1所述的厦门链霉菌菌株,其特征在于,所述质粒pIB1884-xim2的构建方法包括以下步骤:
S1、合成含有内源性组成型启动子18840p以及同尾酶的DNA片段,并克隆至pIB139的NsiI/EcoRI位点生成质粒pIB1884;
S2、以Streptomyces xiamenensis318基因组为模板,扩增含厦门霉素合成基因ximB、ximC、XimD和XimE的目的片段;
S3、将步骤S2得到的目的片段与质粒pIB1884重组,然后转化,即得质粒pIB1884-xim2。
3.根据权利要求2所述的厦门链霉菌菌株,其特征在于,步骤S2中,所述扩增采用的引物对序列如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示。
4.一种根据权利要求1-3任一项所述的厦门链霉菌菌株在生产苯并吡喃类化合物和4-氢喹啉类化合物中的应用;所述苯并吡喃类化合物为所述4-氢喹啉类化合物为
5.一种苯并吡喃类化合物和4-氢喹啉类化合物的生产方法,其特征在于,包括以下步骤:将权利要求1-3任一项所述的厦门链霉菌株接入培养基中预培养,然后进行发酵培养并喂养相应4羟基苯甲酸类似物,培养后,萃取即得;苯并吡喃类化合物为所述4-氢喹啉类化合物为
6.根据权利要求5所述的生产方法,其特征在于,生产苯并吡喃类化合物时,所述发酵培养过程为:28~30℃之间,200~220rpm之间培养6-10天;且在培养1天后加入终浓度为50~110mg/L的2,4-二羟基苯甲酸或2-氯-4-羟基苯甲酸。
7.根据权利要求5所述的生产方法,其特征在于,生产4-氢喹啉类化合物时,所述发酵培养过程为:28~30℃之间,200~220rpm之间培养6-10天;且在培养1天后加入终浓度为50~110mg/L的4-氨基苯甲酸。
8.根据权利要求5所述的生产方法,其特征在于,所述预培养采用的培养基为含30~50μg/mL阿泊拉霉素的TSB培养基,培养28~36小时。
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