[发明专利]提高下一代测序建库成功率的方法和系统有效
申请号: | 201911277727.3 | 申请日: | 2019-12-10 |
公开(公告)号: | CN111020005B | 公开(公告)日: | 2023-06-30 |
发明(设计)人: | 郭志伟;李英辉;陈倩;胡荣君 | 申请(专利权)人: | 上海臻迪基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/10;C12N15/11;C40B50/06;C40B80/00 |
代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 许亦琳 |
地址: | 201318 上海市浦东*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 提高 下一代 测序建库 成功率 方法 系统 | ||
1.一种提高下一代测序建库成功率的方法,其包括以下步骤:
1)使包含分子标签的接头与单链模板接触,得到连接产物;
2)使扩库引物和所述连接产物接触,得到建库产物;
其特征在于,所述接头与单链模板的连接是单链单端连接,所述分子标签中的每一个包含非连续的随机序列,所述分子标签还包含固定序列,所述随机序列与所述固定序列互为间隔;
单段所述固定序列包含的碱基数是1-4个;
当被随机序列所间隔的相邻两段固定序列的碱基数都是1个时,所述相邻的固定碱基不相同;
当单段所述固定序列包含的碱基数是2-4个时,所述固定序列不是四种碱基中单种碱基的重复;
所述固定序列在单个所述分子标签中出现的频率是1-7次;
单段所述随机序列包含的碱基数是1-4个,且所述随机序列的碱基总数为8-12;和所述包含分子标签的接头与步骤2)中的所述扩库引物3'端最后十个碱基中的连续配对不超过8个。
2.如权利要求1所述的提高下一代测序建库成功率的方法,
还包括使用步骤2)中的所述扩库引物对所述包含分子标签的接头进行背景检测;
当所述接头的背景均低于阈值时,所述接头被选用;当所述接头的背景高于阈值时,所述接头被弃用;
其特征在于,所述阙值被设定为低于连续的随机序列构成的分子标签的接头的背景值。
3.一种用于提高下一代测序建库成功率的寡核苷酸接头,
包括权利要求1-2中任一项所述的分子标签序列;其包括如SEQ ID NO:3-NO:7及SEQID NO:15-NO:18中任一所述的序列。
4.如权利要求3所述的用于提高下一代测序建库成功率的寡核苷酸接头,其特征在于,
还包括样本标签序列和测序通用序列。
5.如权利要求3所述的用于提高下一代测序建库成功率的寡核苷酸接头,其特征在于,所述寡核苷酸接头的5'端被修饰;
和,所述寡核苷酸接头为单链或具有黏性末端。
6.如权利要求5所述的用于提高下一代测序建库成功率的寡核苷酸接头,其特征在于,所述修饰是磷酸化修饰。
7.如权利要求3所述的用于提高下一代测序建库成功率的寡核苷酸接头,其特征在于,所述寡核苷酸接头为单链或具有黏性末端。
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