[发明专利]一种预测肝癌转移模式及风险的检测panel及其应用

说明书

本发明公开了一种预测肝癌转移模式及风险的检测panel，其包括基因TP53、NOTCH2、FANCD2、TSC1、PBRM1，本发明还公开了含有检测panel的检测试剂盒。同时，本发明还公开利用该检测试剂盒对肝癌患者的肝癌转移模式及风险的判断方法。基于本发明的检测panel，可以实现对肝癌患者肝癌转移模式及风险的精准预测，不仅能够判断其是否具有肝癌转移的风险，且能够准确的预测出其转移模式为腹腔内转移还是腹腔外转移，为临床诊断提供可靠的依据。

技术领域

本发明属于基因检测技术领域，具体涉及一种预测肝癌转移模式及风险的检测panel及其应用。

背景技术

肝癌是我国最常见的恶性肿瘤之一，发病率和病死率高。肝癌的治疗一般采取手术、放化疗和中药结合疗法，肝癌复发转移是影响患者疗效和获得长期生存的关键之一，是当前肝癌研究的热点。肝癌的转移复发是一个多步骤、涉及许多调控因素的复杂过程。目前已知有细胞基因改变、细胞表面结构和黏附能力、局部血管生成能力、细胞代谢功能以及癌细胞与宿主、癌细胞与细胞间质之间相互作用等过程参与肝癌的转移复发。肝癌的转移进程分为三步：肿瘤细胞获得向外侵袭和播散的能力使得肿瘤细胞离原发器官侵入循环系统；肿瘤细胞凋亡耐受使肿瘤细胞在循环系统中生存和转运；肿瘤在转移部位的生长。肿瘤在上皮-间叶细胞转化，肿瘤细胞间蛋白水解酶的合成，肿瘤细胞与基底膜的黏着，免疫系统免疫识别低下，一些细胞因子及受体的改变等因素都可以通过影响以上进程来促进肝癌的转移。

由于肝癌的治疗以手术治疗为最好，但即使早期切除，5年内仍有半数患者转移复发；近年开展肝癌的局部治疗(如射频等)，其转移复发率比切除还要高；即使作肝移植，癌转移复发仍然是首要问题。目前，已知许多癌基因可以诱导或促进癌细胞的转移潜能，如Ras、 Myc、Raf、Fos、EGFR和c-Met等，但是并未有相关分析能够提供针对肝癌转移风险及模式的精准预测，在早期临床应用中，如何能够为医生和患者提供肝癌重要的复发转移预测信息，这是一个亟待解决的问题。

发明内容

本发明为了解决上述技术问题，以262个肿瘤相关基因为一个基因集，以测序结果进行筛选，利用筛选后的基因检测panel来预测肝癌转移风险以及肝癌转移模式，为肝癌的复发转移提供相关预测信息，为医生和患者提供重要肝癌的复发转移基因层面的预测信息。

第一方面，本发明提供了一种预防肝癌转移模式和风险的检测p anel，其组成为基因TP53、NOTCH2、FANCD2、TSC1、PBRM1。

所述基因TP53的核苷酸序列在数据NCBI登录号为：NG_0170 13.2，所述基因NOTCH2的核苷酸序列在数据NCBI登录号为：NG _008163.1，所述基因FANCD2的核苷酸序列在数据库NCBI登录号为：NG_007311.1，所述基因TSC1的核苷酸序列在数据库NCBI登录号为：NG_012386.1，所述基因PBRM1的核苷酸序列在数据库N CBI登录号为：NG_032108.1。

本发明经过对262个基因的筛选，最终获得了由基因TP53、NO TCH2、FANCD2、TSC1、PBRM1等5个基因组成的基因集，形成检测panel，采用本发明提供的检测panel，可以精准的预测肝癌患者的肝癌转移风险及模式。针对检测panel中的五个基因的突变情况进行检测，存在基因TP53、NOTCH2、FANCD2中至少一个基因的突变，表示所述肝癌患者存在肝癌腹腔外转移的风险；如果存在基因T SC1、PBRM1中至少一个基因的突变，表示所述肝癌患者存在肝癌腹腔内转移的风险。

第二方面，本发明提供了所述的检测panel在制备预测肝癌转移模式及风险的产品中的应用。

进一步地，所述产品为检测装置或检测试剂盒。

进一步地，所述试剂盒包括检测探针，所述检测探针针对检测p anel中基因的外显子区域和部分内含子区域。