[发明专利]一种基于蛋白质空间结构的二硫键预测方法在审
| 申请号： | 201911310982.3 | 申请日： | 2019-12-18 |
| 公开（公告）号： | CN111161792A | 公开（公告）日： | 2020-05-15 |
| 发明（设计）人： | 李炜 | 申请（专利权）人： | 南通大学 |
| 主分类号： | G16B15/30 | 分类号： | G16B15/30 |
| 代理公司： | 北京科家知识产权代理事务所(普通合伙) 11427 | 代理人： | 徐思波 |
| 地址： | 226019 *** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 基于 蛋白质 空间结构 二硫键 预测 方法 | ||
【权利要求书】：
1.一种基于蛋白质空间结构的二硫键预测方法，其特征在于，包括如下步骤：
（1）输入待进行二硫键预测的蛋白质序列信息，使用SWISS-MODEL服务器获取目的蛋白质的结构信息；
（2）把所有与目的蛋白相关的结构列出，选择与其序列类似度最高的蛋白结构作为目的蛋白结构；
（3）围绕目的蛋白结构，列出所有半胱氨酸的硫原子的空间位置坐标；
（4）根据距离临界值判断标准预测某一对半胱氨酸侧链硫原子之间是否形成二硫键，并把目的蛋白结构中所有形成二硫键的半胱氨酸对列出，包括其侧链硫原子间距。
2.根据权利要求1所述的基于蛋白质空间结构的二硫键预测方法，其特征在于，步骤（3）中，半胱氨酸1侧链硫原子A的坐标为[x1, y1, z1]，半胱氨酸2侧链硫原子B的坐标为[x2, y2, z2]，根据上述坐标计算出所有AB的原子对之间的空间距离d(A, B)，具体公式如下：
。
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