[发明专利]一种基于illumina测序平台的DNA文库构建试剂盒、文库构建方法和应用在审
申请号: | 201911315233.X | 申请日: | 2019-12-19 |
公开(公告)号: | CN111005074A | 公开(公告)日: | 2020-04-14 |
发明(设计)人: | 刘江辉;马焕班;卢超;吕艳花;王伟凤 | 申请(专利权)人: | 江西海普洛斯医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C12Q1/6806 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 巩克栋 |
地址: | 334000 江西省上饶市*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 illumina 平台 dna 文库 构建 试剂盒 方法 应用 | ||
1.一种DNA文库构建试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括P7接头和P5接头;
所述P7接头的核酸序列如SEQ ID NO:1~5所示;
所述P5接头的核酸序列如SEQ ID NO:6~10所示。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括酶组合物和/或缓冲液;
优选地,所述酶组合物包括末端修复酶、PCR扩增酶或T4 DNA连接酶中的任意一种或至少两种的组合;
优选地,所述缓冲液包括末端修复缓冲液和/或连接缓冲液。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述末端修复酶包括T4多聚核苷酸激酶、T4 DNA聚合酶、Taq DNA聚合酶或Klenow片段中的任意一种或至少两种的组合;
优选地,所述T4多聚核苷酸激酶的工作浓度为0.1~0.4U/μL;
优选地,所述T4 DNA聚合酶的工作浓度为0.05~0.09U/μL;
优选地,所述Taq DNA聚合酶的工作浓度为0.03~0.07U/μL;
优选地,所述Klenow片段的工作浓度为0.01~0.03U/μL。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR扩增酶包括Q5热启动DNA聚合酶;
优选地,所述Q5热启动DNA聚合酶的工作浓度为1×;
优选地,所述T4 DNA连接酶的工作浓度为10~30U/μL。
5.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述末端修复缓冲液包括10×T4 DNA连接酶缓冲液、dNTP混合液、PEG8000和超纯水;
优选地,所述10×T4 DNA连接酶缓冲液包括ATP、Tris-HCl、MgCl2、DTT和超纯水;
优选地,所述10×T4 DNA连接酶缓冲液的工作浓度为0.8~2×;
优选地,所述dNTP混合液的工作浓度为0.3~0.6mM;
优选地,所述PEG8000的工作浓度为5~10wt%。
6.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述连接缓冲液包括ATP、Tris-HCl、MgCl2、DTT、PEG8000、DMSO和超纯水;
优选地,所述ATP的工作浓度为0.1~0.5mM;
优选地,所述Tris-HCl的工作浓度为0.01~0.05M;
优选地,所述MgCl2的工作浓度为0.001~0.003M;
优选地,所述DTT的工作浓度为0.001~0.003M;
优选地,所述PEG8000的工作浓度为5~10wt%;
优选地,所述DMSO的工作浓度为0.8%~2%。
7.根据权利要求1-6任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR引物;
优选地,所述PCR引物的核酸序列如SEQ ID NO:11~12所示。
8.一种文库构建方法,其特征在于,所述方法采用如权利要求1-7任一项所述的试剂盒进行文库构建;
优选地,所述方法包括以下步骤:
(1)对基因组DNA进行超声处理,得到片段化的基因组DNA;
(2)采用末端修复酶和末端修复缓冲液对片段化基因组DNA进行末端修复和加A反应;
(3)采用T4 DNA连接酶和连接缓冲液对末端修复加A产物进行P7、P5接头连接反应;
(4)采用磁珠进行连接产物纯化;
(5)采用Q5热启动DNA聚合酶和PCR引物对纯化产物进行PCR扩增,构建得到所述DNA文库。
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