[发明专利]一种基于illumina测序平台的DNA文库构建试剂盒、文库构建方法和应用在审

专利信息
申请号: 201911315233.X 申请日: 2019-12-19
公开(公告)号: CN111005074A 公开(公告)日: 2020-04-14
发明(设计)人: 刘江辉;马焕班;卢超;吕艳花;王伟凤 申请(专利权)人: 江西海普洛斯医学检验实验室有限公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06;C12Q1/6806
代理公司: 北京品源专利代理有限公司 11332 代理人: 巩克栋
地址: 334000 江西省上饶市*** 国省代码: 江西;36
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 illumina 平台 dna 文库 构建 试剂盒 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种DNA文库构建试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括P7接头和P5接头;

所述P7接头的核酸序列如SEQ ID NO:1~5所示;

所述P5接头的核酸序列如SEQ ID NO:6~10所示。

2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括酶组合物和/或缓冲液;

优选地,所述酶组合物包括末端修复酶、PCR扩增酶或T4 DNA连接酶中的任意一种或至少两种的组合;

优选地,所述缓冲液包括末端修复缓冲液和/或连接缓冲液。

3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述末端修复酶包括T4多聚核苷酸激酶、T4 DNA聚合酶、Taq DNA聚合酶或Klenow片段中的任意一种或至少两种的组合;

优选地,所述T4多聚核苷酸激酶的工作浓度为0.1~0.4U/μL;

优选地,所述T4 DNA聚合酶的工作浓度为0.05~0.09U/μL;

优选地,所述Taq DNA聚合酶的工作浓度为0.03~0.07U/μL;

优选地,所述Klenow片段的工作浓度为0.01~0.03U/μL。

4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR扩增酶包括Q5热启动DNA聚合酶;

优选地,所述Q5热启动DNA聚合酶的工作浓度为1×;

优选地,所述T4 DNA连接酶的工作浓度为10~30U/μL。

5.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述末端修复缓冲液包括10×T4 DNA连接酶缓冲液、dNTP混合液、PEG8000和超纯水;

优选地,所述10×T4 DNA连接酶缓冲液包括ATP、Tris-HCl、MgCl2、DTT和超纯水;

优选地,所述10×T4 DNA连接酶缓冲液的工作浓度为0.8~2×;

优选地,所述dNTP混合液的工作浓度为0.3~0.6mM;

优选地,所述PEG8000的工作浓度为5~10wt%。

6.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述连接缓冲液包括ATP、Tris-HCl、MgCl2、DTT、PEG8000、DMSO和超纯水;

优选地,所述ATP的工作浓度为0.1~0.5mM;

优选地,所述Tris-HCl的工作浓度为0.01~0.05M;

优选地,所述MgCl2的工作浓度为0.001~0.003M;

优选地,所述DTT的工作浓度为0.001~0.003M;

优选地,所述PEG8000的工作浓度为5~10wt%;

优选地,所述DMSO的工作浓度为0.8%~2%。

7.根据权利要求1-6任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR引物;

优选地,所述PCR引物的核酸序列如SEQ ID NO:11~12所示。

8.一种文库构建方法,其特征在于,所述方法采用如权利要求1-7任一项所述的试剂盒进行文库构建;

优选地,所述方法包括以下步骤:

(1)对基因组DNA进行超声处理,得到片段化的基因组DNA;

(2)采用末端修复酶和末端修复缓冲液对片段化基因组DNA进行末端修复和加A反应;

(3)采用T4 DNA连接酶和连接缓冲液对末端修复加A产物进行P7、P5接头连接反应;

(4)采用磁珠进行连接产物纯化;

(5)采用Q5热启动DNA聚合酶和PCR引物对纯化产物进行PCR扩增,构建得到所述DNA文库。

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