[发明专利]一种用于检测ABO血型系统中O基因突变的SNP标记有效
申请号: | 201911351714.6 | 申请日: | 2019-12-24 |
公开(公告)号: | CN111304311B | 公开(公告)日: | 2022-09-13 |
发明(设计)人: | 朱于莉;刘丽;韩斌;冯智慧;胡彬 | 申请(专利权)人: | 青岛市中心血站 |
主分类号: | C12Q1/6881 | 分类号: | C12Q1/6881;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 | 代理人: | 曾庆国 |
地址: | 266071 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 abo 血型 系统 基因突变 snp 标记 | ||
本发明的目的是提供一种用于检测ABO血型系统O型变异型的SNP位点,新的O型变异型基因编码区域由起始密码子起第484至492位删失gtgacgctg碱基。本发明提供了一种新的O型变异型基因,从而完善了ABO基因库,提供了一种快速基因诊断、基因筛查及遗传咨询的途径,应用效果表明本发明所提供的基因的SNP位点及检测引物可以有效的应用于献血员和临床患者外周血进行新的O型变异型基因突变位点的快速检测。
技术领域
本发明属于基因诊断制品技术领域,具体涉及一种用于检测ABO血型系统中O基因突变的SNP标记。
发明背景
ABO血型系统是由奥地利病理学家、免疫学家Karl Landsteiner在1900年发现并命名的人类第一个血型系统,也是目前为止最为重要的血型系统,在临床输血、新生儿溶血病中占有重要地位,他也因此获得了诺贝尔生理学和医学奖。ABO血型系统是根据红细胞表面有无特异性抗原(凝集原)A和B来划分的血型系统。根据凝集原A、B的分布把红细胞分为A、B、AB和O四型。进一步,1924年德国学者F.Bernstein证明ABO血型分别为三个复等位基因所控制,在ABO抗原的生物合成中A、B、O三个等位基因控制着A、B抗原的形成。ABO抗原的前体是H抗原;A基因编码一种叫N-乙酰半乳糖胺转移酶的蛋白质(A酶),能把H抗原转化成A抗原;B基因编码一种叫半乳糖转移酶的蛋白质(B酶),能把H抗原转化成B抗原;O基因不能编码有活性的酶,而只有H抗原。
输血时若血型不合会使输入的红细胞发生凝集,导致急性溶血性输血反应(AcuteHemolytic Transfusion Reaction,AHTR),引起血管阻塞和血管内大量溶血,多于输血后立即发生,是最严重的输血副反应,一旦发生需立即抢救,否则致死率很高。所以在输血前必须作血型鉴定。正常情况下只有ABO血型相同者可以相互输血。在缺乏同型血源的紧急情况下,因O型红细胞无凝集原,不会被凝集,可输给任何其他血型的人。AB型的人,血清中无凝集素,可接受任何型的红细胞。但是异型输血输入量大时,输入血中的凝集素未能被高度稀释,有可能使受血者的红细胞凝集。所以大量输血时仍应采用同型血。
目前各地血液中心或临床输血科对献血员和患者均采用血清学实验进行ABO血型鉴定,但血清学实验会到疾病、药物或者个体情况的干扰,比如肿瘤、白血病等某些疾病会影响血型抗原从而导致正定型不准确;而血清中自身抗体或不规则抗体的干扰,会干扰反定型导致定型困难甚至定型错误。而相对于这些不足之处,分子生物学技术在这几方面均有优势,并且随着科技时代的发展和大数据时代的来临,采用DNA直接测序来检测ABO血型必定是大势所趋,因此,对于ABO血型的分子机制研究必须充分和完善。只有将分子机制研究充分、透彻,才有可能以分子生物学来代替血型血清学检测ABO血型、进行基因分型、用基因直接计数法统计计算基因多态性分布。
发明内容
本发明的目的是提供一种用于检测ABO血型系统中O基因突变的SNP标记,可以完善ABO基因库的数据,从而弥补现有技术的不足。
申请人对一个呈常染色体9q34.1-9q34.2遗传的变异型血型基因的家系成员进行了测序,找到了该家系成员O型变异型基因存在遗传上的突变,导致H抗原无法转变为A抗原或B抗原,从而提供了一种为O血型的准确定型、避免通过输血造成急性溶血性输血反应的检测位点。
本发明首先提供一种与ABO血型系统中O基因突变相关的SNP位点,为ABO血型基因(NCBI Reference Sequence:NM_020469.3)编码区ATG起始第484位到492位;缺失GTGACGCTG共9个碱基。
本发明的另一个方面提供一种用于检测红细胞ABO血型的制品,所述的制品是用于检测上述的SNP位点;
所述的制品为PCR扩增测序试剂盒,其中包含有检测上述SNP位点的直扩增引物;
其中扩增引物的序列信息如下:
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