[发明专利]一种肺癌GNAQ突变基因及其检测引物和应用

说明书

本发明公开了一种肺癌GNAQ突变基因及其检测引物和应用。一种肺癌GNAQ突变基因，该突变位于GNAQ基因的5号外显子上，CDS序列第680位碱基T突变为C，对应第227位的氨基酸由甲硫氨酸突变为苏氨酸。检测所述的肺癌GNAQ突变基因的试剂在制备肺癌辅助诊断试剂中的应用。所述的检测肺癌GNAQ突变基因的试剂优选检测肺癌GNAQ突变基因的PCR引物。本发明公布了一种新的肺癌GNAQ基因突变，并验证了该突变具有高度致病性可能。本发明提供了检测该突变的引物序列及相关反应体系，通过PCR扩增测序实现该突变位点检测，可用于制备肺癌辅助诊断试剂，比NGS更加快速、简便、低成本。

技术领域

本发明属于生物医学检测领域，涉及一种肺癌GNAQ突变基因及其检测引物和应用。

背景技术

肺癌是全世界最常见的恶性肿瘤，也是癌症相关死亡的首位死因。在我国，其发病率和死亡率亦居首位。但由于缺乏有效的早期诊断方法，导致70％-80％的患者在确诊时已处于晚期，预后不佳，5年生存率仅15％。近年来随着基因分析和分子诊断技术的不断发展及测序技术的应用，越来越多的肺癌基因靶点被陆续发现，解析肺癌的遗传特征谱以及找到更多新型的肺癌驱动基因不仅可以使肺癌分子诊断的方法更加简单、快速，而且可以为肺癌的靶向治疗提供更多潜在药物靶点，以提高患者的预后及远期生存率，为肺癌患者长期生存带来新的希望。

G蛋白，又称鸟苷酸结合调节蛋白，是位于细胞膜内侧的一类重要的信号转导蛋白，它能接受多种激素及神经递质的跨膜转导，主要通过与GTP(激活态)结合和与GDP(失活态)结合导致信号的转导和终止，继而引发细胞代谢、分泌、增殖、分化、病变、死亡等一系列生理效应。G蛋白属于一个庞大的三体蛋白家族，由α、β、γ三个亚单位组成异源三聚体，每种亚基都由不同基因编码。目前，已发现的G蛋白α亚单位就有20多种。G蛋白的α亚基都具有GTP水解酶(GTPase)活性，能够使结合的GTP水解成GDP并释放出磷酸基团。

GNAQ(G protein subunit alpha q)被证明是一种癌基因，该基因位于染色体9q21.2，由8个外显子组成，该基因编码G蛋白α亚基。最常见的突变位点是5号外显子的Q209和4号外显子的R183。2009年，Van Raamsdonk和他的同事首先发现了GNAQ在肿瘤发展中的作用。他们报道了83％的葡萄膜黑色素瘤中含有该基因的突变，其中95％的突变发生在Q209，5％的突变发生在R183。突变是互斥的。GNAQ发挥GTPase活性需要位于5号外显子编码的开关II区Q209位置的谷氨酰胺，但是GNAQ基因Q209位的错义突变导致了Gα蛋白的GTPase功能的消失及下游信号的持续激活，并促进细胞增殖，从而导致肿瘤的发生。后续研究证实了GNAQ突变还可以见于蓝痣，皮肤黑色素瘤及脑膜肿瘤等。

GNAQ突变与肿瘤分期、染色体畸变或其他临床表现不相关，但由于GNAQ参与于肿瘤进展的各个阶段，表明GNAQ突变很可能是肿瘤的始动因素或早期事件。然而目前对GNAQ突变的研究并不多，大多数报道显示该基因突变与非皮肤性黑色素瘤相关，而在其他肿瘤中罕见报道。由于相关数据的缺乏，GNAQ还有很多未发现的突变位点，其与肿瘤之间的相关性及病理机制也还不明确。GNAQ基因新突变的发现有助于揭示信号转导异常与恶性肿瘤的关联，并为新疗法和新药物的设计提供思路与靶点。

目前高通量测序是唯一可以明确未知突变位点的检测手段,然而高通量测序费用高昂，检测周期长，检测平台稀缺，对样品质量要求高，不利于普及推广，对于大多数患者来说也不是首选检测手段。因此，针对新发现的致病突变位点设计特异性的PCR引物进行PCR扩增并测序，是准确、便捷、经济的方法，对于肿瘤基因诊断和靶向治疗的选择具有重要意义。

发明内容

本发明的目的是针对现有技术，提供一种肺癌GNAQ突变基因。

本发明的另一目的是提供该肺癌GNAQ突变基因的检测引物。

本发明的又一目的是提供一种肺癌辅助诊断试剂盒。