[发明专利]一种RNA放大检测方法及检测试剂盒在审
申请号: | 201911380925.2 | 申请日: | 2019-12-27 |
公开(公告)号: | CN111378724A | 公开(公告)日: | 2020-07-07 |
发明(设计)人: | 居金良;崔振玲;于明辉;张帝;耿玥 | 申请(专利权)人: | 上海仁度生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/682;C12N15/11 |
代理公司: | 北京尚诚知识产权代理有限公司 11322 | 代理人: | 鲁兵 |
地址: | 201201 上海市浦东新区张江*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 rna 放大 检测 方法 试剂盒 | ||
1.一种RNA放大检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)将含有待测样品RNA、引物、探针、荧光探针和相关聚合酶的反应物混合为反应混合物;
2)将反应混合物置于密闭容器中进行恒温放大反应,并用检测仪同步检测反应体系中荧光信号的变化,定量或定性检测待测样品RNA。
2.根据权利要求1所述的RNA放大检测方法,其特征在于:所述反应混合物包含以下组分:
a.待测样品RNA;
b.第一引物:所述第一引物的序列包含启动子序列和共同引物序列,其中所述共同引物序列为与所述待测样品RNA非同源的序列;可选的,所述启动子序列为T7启动子序列;可选的,所述第一引物的核苷酸序列为序列表中SEQ ID NO:1所示;
c.探针A:所述探针A的3’端序列为与待测样品RNA特异性结合的序列,5’端序列为所述第一引物的序列;
d.探针B:作为第二引物,其序列与所述待测样品RNA序列一致;
e.荧光探针,用于与所述恒温放大反应产物结合;
f.逆转录酶;和
g.识别所述启动子序列的RNA聚合酶;
优选的,还包含:
h.含有特异性捕获探针的固相支持物,所述特异性捕获探针用于捕获待测样品RNA。
3.根据权利要求2所述的RNA放大检测方法,其特征在于,所述待测样品RNA的获得方法包括以下步骤:
11)RNA试样制备;
12)向所述RNA试样中添加核酸提取液,混匀后进行提取,获得待测样品RNA;其中所述核酸提取液包含探针A和含有特异性捕获探针的固相支持物,所述探针A用于与所述待测样品RNA特异性结合,以引入第一引物序列;
具体地,步骤12)中所述固相支持物为磁性颗粒,所述提取的流程具体为:
121)向所述RNA试样中添加所述核酸提取液,混匀后在55-95℃下孵育8-12min,室温静置至提取液混合物恢复到室温,磁力架上吸磁至少1min,弃上清;
122)加入洗涤液(HEPES 10mM,NaCl 50mM,1%SDS,EDTA 5mM)重悬磁性颗粒,磁力架上吸磁1-3min,弃上清;
123)重复步骤122),获得待测样品RNA。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的RNA放大检测方法,其特征在于,步骤1)中所述反应混合物的获得方法具体包括以下步骤:
T1)第一步反应混合:向所述待测样品RNA中加入第一步反应液和酶液进行反应,获得第一步反应产物,其中所述第一步反应液包含第二引物,所述酶液中含有逆转录酶和识别所述启动子序列的RNA聚合酶;优选第一步反应条件为:37-45℃下反应3-10min;
T2)第二步反应混合:向所述第一步反应产物中加入第二步反应液,获得反应混合物,其中所述第二步反应液包含第一引物和荧光探针。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的RNA放大检测方法,其特征在于,步骤2)中所述恒温放大反应的条件为:37-45℃下反应20-60min。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的RNA放大检测方法,其特征在于,所述第一步反应液的组分为:10-50mM Tris,20-90mM KCl,10-50mM MgCl2,0.1-10mM NTPS,0.1-10mMdNTPs,5-40%甘油,0-25%DMSO,0.01-2μM第二引物;
所述第二步反应液的组分为:10-50mM Tris,20-90mM KCl,10-50mM MgCl2,0.1-10mMNTPS,0.1-10mM dNTPs,5-40%甘油,0-25%DMSO,0.01-2μM第一引物,0.01-2μM荧光探针;
所述酶液的组分为:100-9000U逆转录酶,100-5000U RNA聚合酶,20-100mM Tris,0.1-1%TritonX-100,30-300mM KCl,0.01-0.5mM EDTA,0.1-2mM DTT,20-50%甘油;
优选地,所述第一步反应液、酶液与所述第二步反应液的用量体积比为(2-3):(1-2):(2-3)。
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