[发明专利]一种与桃果形性状共分离的染色体倒位及其应用

说明书

本发明公开了一种与桃果形性状共分离的染色体倒位及其应用，涉及植物分子生物学技术。与桃果形性状共分离的染色体倒位近断点附近核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，远断点附近核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。利用倒位断点两侧核苷酸序列设计分子标记，用于育种中的标记辅助筛选，能提前筛选果形性状。所述的引物序列如SEQ ID NO.5、6……10所示。本发明具有下列优点和积极效果：①本发明揭示的S基因座大片段染色体倒位更有可能是导致桃果形发生扁平突变的关键原因；②本发明利用包含三对引物的分子标记能对个体果形性状做到精确判断或预测；③本发明找到的控制扁平果形的染色体倒位用于标记辅助选择，指导桃的杂交育种，能提前进行筛选，节约育种时间，提高育种效率。

技术领域

本发明涉及植物分子生物学技术，属于基因组结构变异及其对植物表型影响的研究，尤其涉及一种与桃果形性状共分离的染色体倒位及其应用。

背景技术

桃是世界上最重要的果树之一，它大约在250万年之前起源于我国青藏高原西南部(Yu Y.et al.,Genome re-sequencing reveals the evolutionary history of peachfruit edibility.Nat Commun 2018；9：5404)。桃在我国的栽培和驯化可追溯到至少4000年前(Scorza R.and Okie W.R.,Peaches(Prunus).Acta Hortic 1991,290:177-234)，之后在罗马时期随丝绸之路传到了欧洲，现已成为温带地区的重要经济果树之一。桃的外部果实品质性状有着广泛的变异，其中无毛果皮(油桃)和扁平果形(蟠桃)是最显著、最重要的两个变异性状。由于蟠桃不仅果实大小和产量处于劣势，而且存在裂果问题，所以扁平果起初并不被人们认为是一个重要的性状，在西方国家的大多数育种项目中，扁形果实性状往往都被淘汰了(R.et al.,Combining linkage and association mapping tosearch for markers linked to the flat fruit character in peach.Euphytica2013；190:279-288)。然而，蟠桃果实酸度相对较低、含糖量较高，具有风味佳等优点，近年来引起了人们广泛的关注。蟠桃原产于中国，因其名字象征着健康和长寿，故其在中国市场上颇受青睐。

桃属于蔷薇科，二倍体物种(2n＝16)，单倍体基因组小，约为230兆碱基对。桃果形包含园形和扁平形两种类型，该性状受单个位点(S)控制，遗传学研究将S位点定位与第6号染色体(Chr)的底部(Dirlewanger E.et al.,Genetic linkage map of peach[Prunuspersica(L.)Batsch]using morphological and molecular markers.Theor ApplGenet1998；97:888-895)。S位点与控制果重和产量的数量性状位点(QTLs)相邻，这就解释了为什么扁桃产量较低、果实较轻。此外，S位点还与控制果实败育、落果的QTL紧密相连，但目前尚不清楚果实败育和扁果性状是否由S位点的同一基因决定。