[发明专利]一种鉴定东北林蛙遗传性别的分子标记及其应用方法在审
申请号: | 201911392151.5 | 申请日: | 2020-04-13 |
公开(公告)号: | CN111593128A | 公开(公告)日: | 2020-08-28 |
发明(设计)人: | 许愿;狄生伟;宁方勇;白秀娟;杜智恒;刘珈羽;苏杭;徐逸男;吕晶 | 申请(专利权)人: | 东北农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 沈阳圣群专利事务所(普通合伙) 21221 | 代理人: | 王玉信 |
地址: | 150000 黑龙*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 东北 遗传性 别的 分子 标记 及其 应用 方法 | ||
1.一种鉴定东北林蛙遗传性别的分子标记及其应用,其特征是按以下步骤操作:
(1)提取东北林蛙脚趾组织的基因组DNA,
(2)以提取的基因组DNA为模板进行PCR扩增反应,PCR扩增反应所用上游引物为SEQ IDNO :1所示序列,即5’-GGCTATTCGTCGCTACTAAAGG-3’ ,下游引物为SEQ ID NO :2所示序列,即5’-GACTGCGTACGAATTTGA-3’;
(3)用14%的聚丙烯酰胺凝胶对PCR扩增产物进行电泳检测,结果具有SEQ ID NO :3所示核苷酸序列对应的222bp条带的个体为遗传雄性东北林蛙,缺失SEQ ID NO :3所示核苷酸序列对应条带的个体为遗传雌性东北林蛙;
(4)对遗传雄性特异性条带进行回收纯化、测序,确定其为东北林蛙性别特异性分子标记,即SEQ ID NO :3,所述分子标记表现为SEQ ID NO :3 所示核苷酸序列,
GGCTATTCGTCGCTACTAAAGGTGGGGTCACTGGCACTTAATGCTGCCCAGTTCTGGGTCTCTAAAGAAGGACCGTTTAACATGAGAGTCTATGGGGAAACAGGGTCATCTTTAGGCATGTGCAGAAGTGAAAAATTTGTTTTGTTTCGTTTCGTTTCAATTCGTCATTTAATACATTTCGTTAAGTTAGGTTCGTTACATGTGTCAAATTCGTACGCAGTC
具有SEQ ID NO :3所示核苷酸序列的个体,表现为遗传雄性东北林蛙,缺失SEQ ID NO3所示核苷酸序列的个体为遗传雌性东北林蛙。
2.根据权利要求1所述的一种鉴定东北林蛙遗传性别的分子标记及其应用,其特征是,所述引物对具有SEQ ID NO :1或SEQ ID NO :2所示的核苷酸序列:
SEQ ID NO :1
GGCTATTCGTCGCTACTAAAGG
SEQ ID NO 2:
GACTGCGTACGAATTTGA。
3.根据权利要求1所述的一种鉴定东北林蛙遗传性别的分子标记及其应用,其特征是,利用所述引物对SEQ ID NO 1-SEQ ID NO 2对待检测东北林蛙基因组进行PCR扩增,当所述扩增产物存在大小为222bp条带时,表明所述待测东北林蛙基因组DNA中具有SEQ ID NO :3所示核苷酸序列,判断待测东北林蛙遗传性别是雄性;当没有出现所述扩增片段时,所述待测个体基因组DNA中缺失SEQ ID NO :3所示核苷酸序列,待测东北林蛙遗传性别是雌性。
4.根据权利要求1所述的一种鉴定东北林蛙遗传性别的分子标记及其应用,其特征是,分析PCR扩增产物时,优选14%聚丙烯酰胺凝胶电泳检测所述扩增产物。
5.根据权利要求1所述的一种鉴定东北林蛙遗传性别的分子标记及其应用,其特征是,分析PCR扩增产物时,电泳电压为120V,电泳时间为10~14h。
6.根据权利要求1所述的一种鉴定东北林蛙遗传性别的分子标记及其应用,其特征是,扩增时,反应体系为10μl,包括10×Buffer(Tris-HCL 200 mM, pH 8.4; KCl 500 mM)1 μl,dNTP(2.5mM)0.2μl, Taq聚合酶(5 U/μl)0.1μl,灭菌去离子水7.1μl,上游引物(10 pm/pl)0.4μl、下游引物(10 pm/pl)0.4μl,模板(50 ng/μl)0.8μl。
7.根据权利要求1所述的一种鉴定东北林蛙遗传性别的分子标记及其应用,其特征是,扩增时,反应条件为:94℃ 4 min,1个循环;94℃ 1 min,35℃ 1 min,72℃ 1 min, 5个循环;94℃ 1 min, 51℃ 1 min,72℃ 1 min,35个循环;72 ℃ 7 min, 1个循环,4℃保存。
8.如权利要求1所述的一种鉴定东北林蛙遗传性别的分子标记的应用,其特征是,用于制备鉴定待测东北林蛙的遗传性别的试剂盒。
9.根据权利要求1所述的一种鉴定东北林蛙遗传性别的分子标记及其应用,其特征是,应用权利要求1的步骤方法,所述分子标记表现为SEQ ID NO :3 所示核苷酸序列确定待测东北林蛙的遗传性别,获得伪雄个体,作为父本与正常雌性抱对排卵,获得高雌性比例的子代。
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