[发明专利]一种与北京鸭抗DHAV-3性状相关的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与北京鸭抗DHAV‑3性状相关的分子标记及其应用。本发明提供了特异SNP，基于特异SNP的基因型可以实现对抗DHAV‑3性状进行选择，GG基因型鸭的抗DHAV‑3感染能力优于AA或AG基因型鸭，特异SNP所在基因的表达水平可以作为检测DHAV‑3的敏感指标，基因表达量低的个体抗病力高于表达量高的个体。本发明可以实现鸭个体/群体对DHAV‑3抗性性状的评估，可以实现对抗DHAV‑3性状进行早期选择，可以通过分子标记辅助育种实现抗性/敏感性鸭群体基因型的快速纯化，能够节省生产成本并加快遗传进展，更好地服务于鸭的育种，具有很大的经济应用价值和科研价值。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种与北京鸭抗DHAV-3性状相关的分子标记及其应用。

背景技术

鸭是中国特色水禽，饲养量占全世界的80％，为人类提供了肉、蛋、绒等产品，且抗病力较强，是研究天然免疫机制的很好模型。传染病是制约北京鸭产业发展的关键因素。2017年，世界鸭肉产量约446万吨，占禽肉产量的3.7％，在鸡肉和火鸡肉之后位居第三。在亚洲、北欧和中欧，鸭肉主要来源于北京鸭。

DHAV-3所致的鸭病毒性肝炎(Duck viral hepatitis,DVH)已成为危害我国养鸭业的重要疾病之一，如不加以控制，死亡率可达90％以上。DVH的传播速度很快，且呈急性发生，病程很短，注射抗体制品往往不能达到预期的治疗效果，为防控DVH，从2014年起，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所水禽营养与育种创新团队针对近年来在亚洲养鸭业流行最为广泛的DHAV-3开展了抗病育种工作，并鉴定出对DHAV-3具有抗性的北京鸭新品系(Z8R系)。迄今为止，已创建了第4世代抗性品系(Z8R4)，这为进一步研究北京抗DHAV-3感染的分子机制提供了良好的研究素材。

高通量时代的到来，使定位基因变异从以候选基因、单一性状为主的微观研究方式向以物种进化构架内的全基因组水平的宏观研究转变，完成了从抽样到整体的升华。通过全基因组关联分析可获得与目标性状紧密联系的分子标记，为后续研究提供前提。

发明内容

本发明的目的是提供一种与北京鸭抗DHAV-3性状相关的分子标记及其应用。

第一方面，本发明首先保护用于检测特异SNP的物质在如下任一中的应用：

(A1)鉴定或辅助鉴定待测鸭DHAV-3抗性；

(A2)制备用于鉴定或辅助鉴定待测鸭DHAV-3抗性的产品；

所述特异SNP为如下(B1)或(B2)：

(B1)鸭基因组第2号染色体的第43395216位核苷酸；

(B2)鸭基因组中序列表的序列1中自5’端第358位核苷酸。

所述用于检测特异SNP的物质为引物对甲或含有所述引物对甲的试剂盒；

所述引物对甲由上游引物和下游引物组成；

所述上游引物为如下(a1)或(a2)：

(a1)序列2所示的DNA分子；

(a2)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代且与序列2具有相同功能的DNA分子；

所述下游引物为如下(a3)或(a4)：

(a3)序列3所示的DNA分子；

(a4)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代且与序列3具有相同功能的DNA分子。

第二方面，本发明保护一种鉴定或辅助鉴定待测鸭DHAV-3抗性的方法，包括如下步骤：检测待测鸭的基因组DNA中基于特异SNP位点的基因型为GG基因型、AA基因型还是AG基因型；GG基因型鸭的DHAV-3抗性在大于AA基因型鸭或AG基因型鸭；