[发明专利]生物信息软件监控系统及方法

权利要求书

1.一种生物信息软件监控系统，其特征在于，包括Docker集群、kafka消息系统、监控模块、生物信息软件和分析模块；

其中，所述Docker集群包括多个Docker容器和每个所述Docker容器所在的计算节点，所述生物信息软件和所述监控模块一一对应；

每个所述生物信息软件与其对应的所述监控模块封装在相应的Docker容器内；

所述监控模块用于当所述监控模块所在的Docker容器在所述计算节点上运行时，实时收集运行的所述Docker容器中生物信息软件的运行环境信息和日志信息，并将所述运行环境信息和日志信息进行分类后推送到所述kafka消息系统中进行保存；

所述分析模块用于对所述kafka消息系统中每种类别的运行环境信息和日志信息进行分析，获取每种类别的运行环境信息和日志信息对应的分析结果；

其中，所述分析模块具体用于：

对所述kafka消息系统中每种类别的运行环境信息进行分析，获取所述生物信息软件的CPU使用情况、IO使用情况和MEM使用情况；

判断所述生物信息软件的CPU使用情况、IO使用情况和MEM使用情况是否超过预设资源限制；

若超过，则将所述生物信息软件超过预设资源限制的消息告知所述Docker容器，以供所述Docker容器进行相应处理，并返回错误码，以供管理人员根据所述错误码获取所述错误码对应的错误原因，根据所述错误原因对所述预设资源限制进行调节。

2.根据权利要求1所述的生物信息软件监控系统，其特征在于，所述分析模块具体用于：

对所述kafka消息系统中每种类别的日志信息进行分析，根据所述日志信息分析的结果更新所述生物信息软件的运行时状态，并标记所述生物信息软件的运行步骤；其中，所述日志信息包括步骤信息和异常信息。

3.根据权利要求1-2任一所述的生物信息软件监控系统，其特征在于，还包括mysql数据库；

其中，所述mysql数据库用于对所述生物信息软件多次运行的运行环境信息和日志信息进行保存；

相应地，还包括离线分析模块，所述离线分析模块用于：

对所述mysql数据库中的运行环境信息和日志信息进行离线分析。

4.根据权利要求3所述的生物信息软件监控系统，其特征在于，所述离线分析模块具体用于：

对所述生物信息软件多次运行的运行环境信息和日志信息进行离线分析，获取所述生物信息软件每次运行的文件大小和所使用的资源大小；

根据所述生物信息软件每次运行的文件大小和所使用的资源大小进行函数拟合，以使用拟合的函数为所述生物信息软件分配资源。

5.一种生物信息软件监控方法，其特征在于，包括：

当Docker集群中的Docker容器在其所在的计算节点上运行时，基于所述Docker容器中封装的监控模块实时收集所述Docker容器中封装的生物信息软件的运行环境信息和日志信息，并将所述运行环境信息和日志信息进行分类后推送到kafka消息系统中进行保存；

基于分析模块对所述kafka消息系统中每种类别的运行环境信息和日志信息进行分析，获取每种类别的运行环境信息和日志信息对应的分析结果；

其中，基于分析模块对所述kafka消息系统中每种类别的运行环境信息进行分析，获取每种类别的运行环境信息对应的分析结果的步骤包括：

对所述kafka消息系统中每种类别的运行环境信息进行分析，获取所述生物信息软件的CPU使用情况、IO使用情况和MEM使用情况；

判断所述生物信息软件的CPU使用情况、IO使用情况和MEM使用情况是否超过预设资源限制；

若超过，则将所述生物信息软件超过预设资源限制的消息告知所述Docker容器，以供所述Docker容器进行相应处理，并返回错误码，以供管理人员根据所述错误码获取所述错误码对应的错误原因，根据所述错误原因对所述预设资源限制进行调节。