[发明专利]一种多重AAV病毒滴度的检测方法有效
申请号: | 201911408708.X | 申请日: | 2019-12-31 |
公开(公告)号: | CN113122657B | 公开(公告)日: | 2022-07-29 |
发明(设计)人: | 吴涛;韩芳婷;刘武青;曾立;焦彦明;陈建儒;陈琛 | 申请(专利权)人: | 上海吉凯基因医学科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/864;C12N15/65;C12R1/93 |
代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 严晨;许亦琳 |
地址: | 200233 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 多重 aav 病毒 检测 方法 | ||
1.一种多重AAV病毒滴度的检测方法,所述多重AAV病毒包括第一腺相关病毒和第二腺相关病毒;
所述第一腺相关病毒包括位于两个ITR序列之间的第一基因表达框,所述第一基因表达框按5’至3’方向依次包括转录起始元件、第一目的基因片段、第一剪接供体信号片段、第一滴度校准片段,所述第一目的基因片段为目的基因5’端片段;
所述第二腺相关病毒包括位于两个ITR序列之间的第二基因表达框,所述第二基因表达框按5’至3’方向依次包括第二滴度校准片段、第一剪接受体信号片段、第二目的基因片段;
所述第一滴度校准片段和第二滴度校准片段的多核苷酸序列如SEQ ID NO. 5所示;
所述检测方法包括:
提供第一腺相关病毒的滴度;
基于第一滴度校准片段和第二滴度校准片段,获取第一腺相关病毒和第二腺相关病毒的检测信号强度,根据两者的检测信号强度的比值,基于第一腺相关病毒的滴度获取第二腺相关病毒的滴度。
2.如权利要求1所述的多重AAV病毒滴度的检测方法,其特征在于,基于转录起始元件提供第一腺相关病毒的滴度。
3.如权利要求1所述的多重AAV病毒滴度的检测方法,其特征在于,通过特异性针对转录起始元件的引物,获取第一腺相关病毒的滴度。
4.如权利要求1所述的多重AAV病毒滴度的检测方法,其特征在于,通过特异性针对滴度校准片段的引物,获取腺相关病毒的检测信号强度。
5.如权利要求1所述的多重AAV病毒滴度的检测方法,其特征在于,所述多重AAV病毒包括第一腺相关病毒至第N腺相关病毒,其中,N为不小于3的正整数,第二腺相关病毒至第N-1腺相关病毒,均包括位于两个ITR序列之间的第n基因表达框,所述第n基因表达框按5’至3’方向包括第2n-2滴度校准片段、第n-1剪接受体信号片段、第n目的基因片段、第n剪接供体信号片段、第2n-1滴度校准片段,所述第N腺相关病毒包括位于两个ITR序列之间的第N基因表达框,所述第N基因表达框按5’至3’方向包括第2N-2滴度校准片段、第N-1剪接受体信号片段、目的基因3’端片段、转录终止元件,其中,n为不大于N-1的正整数,且n不为1。
6.如权利要求5所述的多重AAV病毒滴度的检测方法,其特征在于,所述检测方法还包括:基于第2n-2滴度校准片段和其前一顺位的滴度校准片段,获取第n腺相关病毒和其前一顺位的腺相关病毒的检测信号强度,根据两者的检测信号强度的比值,基于其前一顺位的腺相关病毒的滴度获取第n腺相关病毒的滴度。
7.如权利要求5所述的多重AAV病毒滴度的检测方法,其特征在于,所述检测方法还包括:基于第2N-2滴度校准片段和其前一顺位的滴度校准片段,获取第N腺相关病毒和其前一顺位的腺相关病毒的检测信号强度,根据两者的检测信号强度的比值,基于其前一顺位的腺相关病毒的滴度获取第N腺相关病毒的滴度。
8.如权利要求5所述的多重AAV病毒滴度的检测方法,其特征在于,所述第n基因表达框按5’至3’方向依次包括第2n-2滴度校准片段、第n-1剪接受体信号片段、第n目的基因片段、第n剪接供体信号片段、第2n-1滴度校准片段;
和/或,第2n-2滴度校准片段与前一顺位的滴度校准片段相配合;
和/或,所述第N基因表达框按5’至3’方向依次包括第2N-2滴度校准片段、第N-1剪接受体信号片段、目的基因3’端片段、转录终止元件;
和/或,第2N-2滴度校准片段与前一顺位的滴度校准片段相配合。
9.如权利要求1所述的多重AAV病毒滴度的检测方法,其特征在于,所述多重AAV病毒为双重AAV病毒,所述第二基因表达框还包括转录终止元件,第二目的基因片段为目的基因3’端片段。
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