[发明专利]通过细菌性宏基因组分析来诊断抑郁症的方法

权利要求书

1.一种为诊断抑郁症提供信息的方法，该方法包括以下过程：

(a)从分离自受试者样品的细胞外囊泡中提取DNA；

(b)使用包含SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2的成对的引物对所提取的所述DNA进行聚合酶链式反应(PCR)；以及

(c)通过对所述PCR的产物进行测序，与来源于正常个体的样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量比较并确定所述受试者样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

2.根据权利要求1所述的方法，其中过程(c)包括比较并确定：来源于选自由疣微菌门(Verrucomicrobia)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、栖热菌门(Thermi)、梭杆菌门(Fusobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)和装甲菌门(Armatimonadetes)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

3.根据权利要求1所述的方法，其中过程(c)包括比较并确定：来源于选自由产芽胞菌纲(Erysipelotrichi)、疣微菌纲(Verrucomicrobiae)、拟杆菌纲(Bacteroidia)、梭菌纲(Clostridia)、叶绿体纲(Chloroplast)、放线菌纲(Actinobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)、腐螺旋菌纲(Saprospirae)、黄小杆菌纲(Flavobacteriia)、噬纤维菌纲(Cytophagia)、恐球菌纲(Deinococci)、鞘脂杆菌纲(Sphingobacteriia)、梭杆菌纲(Fusobacteriia)、菌毛单胞菌纲(Fimbriimonadia)、TM7-1纲、土圈菌纲(Pedosphaerae)、颤藻亚纲(Oscillatoriophycideae)、厌氧绳菌纲(Anaerolineae)、酸杆菌-6纲(Acidobacteria-6)、索利氏菌纲(Solibacteres)、念珠藻亚纲(Nostocophycideae)和iii1-8纲组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。

4.根据权利要求1所述的方法，其中过程(c)包括比较并确定：来源于选自由苏黎世杆菌目(Turicibacterales)、产芽胞菌目(Erysipelotrichales)、疣微菌目(Verrucomicrobiales)、RF39目、拟杆菌目(Bacteroidales)、肠杆菌目(Enterobacteriales)、梭菌目(Clostridiales)、巴氏杆菌目(Pasteurellales)、鞘脂单胞菌目(Sphingomonadales)、芽孢杆菌目(Bacillales)、黄单胞菌目(Xanthomonadales)、木霉菌目(Streptophyta)、红细菌目(Rhodobacterales)、柄杆菌目(Caulobacterales)、放线菌目(Actinomycetales)、腐螺旋菌目(Saprospirales)、根瘤菌目(Rhizobiales)、黄杆菌目(Flavobacteriales)、噬纤维菌目(Cytophagales)、粘球菌目(Myxococcales)、立克次体目(Rickettsiales)、栖热菌目(Thermales)、红螺菌目(Rhodospirillales)、异常球菌目(Deinococcales)、鞘脂杆菌目(Sphingobacteriales)、梭杆菌目(Fusobacteriales)、菌毛单胞菌目(Fimbriimonadales)、BD7-3目、土圈菌目(Pedosphaerales)、气单胞菌目(Aeromonadales)、色球藻目(Chroococcales)、I025目、蛭弧菌目(Bdellovibrionales)、iii1-15目、索利氏菌目(Solibacterales)、PYR10d3目和DS-18目组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。