[发明专利]用于治疗葡萄球菌感染的治疗性噬菌体组合物

说明书

本发明涉及包含能够感染并裂解金黄色葡萄球菌的一种或多种(适当地两种或更多种，或三种)专性裂解性噬菌体的噬菌体组合物，并且涉及其在治疗金黄色葡萄球菌细菌感染中的应用。

交叉引用的申请

本申请要求于2018年1月2日提交的美国临时申请No.62/613,050、于2018年5月31日提交的美国临时申请No.62/678,611和于2018年9月14日提交的美国临时申请No.62/731,775的优先权，这些临时申请通过引用完整地结合于此。

序列表

本申请含有序列表，其已经以ASCII格式电子提交并且由此通过引用完整地结合于此。所述ASCII副本于2019年1月2日创建，命名为054249-502001WO_Sequence_Listing_ST25并且大小为1.77兆字节。

技术领域

本文描述了噬菌体、噬菌体组合物、及其在医学和非医学应用中的用途。

背景技术

逐渐增加数目的对抗生素具有抗性的人病原体已经产生了对于严重细菌感染的新治疗的迫切需求。规避抗生素抗性的传统机制的新方法可以有效抗生物膜，并且特别希望避免破坏天然肠道菌群。该临床挑战已经重新激发了对于噬菌体疗法的兴趣。

发明内容

本文提供了噬菌体，包括非天然存在的噬菌体，噬菌体组合物。该组合物可以基本上不含细菌组分如细菌内毒素和宿主细胞组分(例如，蛋白质)。组合物可以包括一种或多种专性裂解性噬菌体和任选地冷冻保护剂或其他赋形剂。在一些方面，噬菌体包括核酸序列，或具有可以包括核苷酸序列的基因组，所述核苷酸序列与以下中任一具有至少93％同一性：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:10。在一些实施方案中，该序列与SEQ ID NO:1-10中的一个或多个不具有100％序列同一性。在一些情形中，每种单个噬菌体不易于普遍性转导和/或不携带抗生素抗性基因。在一些实施方案中，一种或多种噬菌体不是天然存在的。

在一个方面，本文提供了噬菌体组合物，其基本上不含细菌组分如细菌内毒素、细菌宿主蛋白等。在一些实施方案中，本文提供了噬菌体组合物，其包括一种或多种能够互补的专性裂解性噬菌体。噬菌体可以包括核酸或基因组，所述核酸或基因组包括与SEQ IDNO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:10中任一具有至少93％同一性的核苷酸序列，和任选地冷冻保护剂。在一些实施方案中，核苷酸序列与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:10中至少一种不具有100％同一性。在一些实施方案中，组合物的目标细菌范围宽于组合物中任何单个噬菌体的范围或组合物中单个噬菌体的总和。在一些实施方案中，组合物中的一种或多种噬菌体不是天然存在的。