[发明专利]数字病理扫描接口和工作流程

说明书

本文公开了一种利用扫描装置获取设置在基底上的生物样品的高分辨率扫描的方法，所述方法包括：在图形用户接口上接收与用户可配置扫描设置相对应的第一用户输入；在图形用户接口上接收第二用户输入以基于所接收到的与所述用户可配置扫描设置相对应的一系列用户输入来发起扫描；以及在所述图形用户接口上显示一个或多个占位符的可视化，所述一个或多个占位符填充有扫描操作状态信息、图像数据和至少一部分所述用户可配置扫描设置中的一者或多者。

相关申请的交叉引用

本申请要求2018年3月6日提交的美国临时专利申请第62/639,375号的申请日的权益，所述申请的公开内容通过引用整体结合于此。

背景技术

组织病理学是指对各种形式的生物样品进行显微镜检查。具体地，在临床医学中，组织病理学是指在活组织检查或手术样品已被处理并将组织学切片置于玻璃样本载玻片上之后由病理学家对所述样品进行的检查。细胞病理学是病理学的一个分支，其在细胞水平上研究和诊断疾病。它通常用于辅助诊断癌症，而且也有助于诊断某些传染病和其他炎性症状，以及甲状腺病变、涉及无菌体腔(腹膜、胸膜和脑脊髓)和大范围的其他身体部位的疾病。细胞病理学通常用于游离细胞或组织碎片的样品(与研究整个组织的组织病理学相反)。

在过去，实验室技术人员或病理学家通常手动地对生物样品执行检查。在手动方法中，在显微镜下以低放大倍率观察用生物样品制备的载玻片以目视定位候选的感兴趣细胞。然后以较高放大倍率观察载玻片上感兴趣细胞所在的那些区域，以确认那些对象为感兴趣细胞，诸如肿瘤或癌细胞。此过程不仅麻烦，而且耗时。通过使用数字图像(即，包含已被数字化的染色生物样品的载玻片的拍摄图像或扫描图像)，此手动过程已得到改善。通常使用显微镜和专用成像硬件获得生物样品的高分辨率数字图像。

相信获得数字样本图像已深刻影响了病理学领域。使用数字图像数据使技术人员或病理学家从某些与物理处理玻璃样本载玻片和手动操作光学仪器相关的任务中解脱出来。另外，数字图像的使用允许对处理和操纵图像进行自动化过程。许多组织机构都被数字病理学系统所吸引，将其作为一种提高生产力和效率的方法，最终改善治疗决策和患者护理。

数字病理学涉及将整个组织病理学或细胞病理学玻片扫描成可在计算机屏幕上解释的数字图像。这些图像随后由成像算法处理或由病理学家解释。为了检查生物样品，使用选择性结合细胞成分的有色组织化学染色剂制备组织切片。病理学家或计算机辅助诊断算法使用颜色增强或染色的细胞结构来识别疾病的形态学标记，并相应地进行治疗。观察所述测定可以实现多种过程，包括疾病诊断、对治疗反应的评估、以及研发抗击疾病的新药物。

发明内容

在本公开文本的一方面中，一种利用载玻片扫描装置获取生物样品的高分辨率图像(例如具有适用于病理学家查看和分析的分辨率的那些图像)的方法，所述方法包括：(i)显示多个非重叠占位符，每个占位符对应于插入所述载玻片扫描装置中的载玻片托盘的载玻片位置，其中每个占位符具有适于传达图像数据的第一部分和适于传达一个或多个数据字段的第二部分；(ii)至少用扫描操作状态信息填充所述多个占位符的每一者的所述第二部分；(iii)利用位于所述载玻片托盘的所述对应载玻片位置处的所述生物样品的预览扫描图像来填充所述多个占位符中的至少一者的所述第一部分；以及(iv)基于接收到的与一个或多个选定的用户接口元素相对应的输入信号，生成至少一个高分辨率扫描图像。在一些实施方案中，所述预览扫描图像是缩略图图像。在一些实施方案中，所述预览扫描图像是高分辨率扫描图像。