[发明专利]利用移植前接受者血液中转录组标志预测急性排斥反应和肾脏同种异体移植物丧失的方法和试剂盒

权利要求书

1.一种用于鉴定处于发生急性排斥反应风险的肾脏同种异体移植物接受者的方法，所述方法包括以下步骤：

(a)确定来自所述肾脏同种异体移植物接受者的移植前血液样本中的基因标志集的表达水平；

(b)将所述基因标志集的表达水平与对照中的基因标志集的表达水平进行比较，和

(c)如果所述样本中的基因标志集中的一种以上的基因的表达水平与所述对照中的基因标志集中的相同的一种以上的基因的表达水平相比发生改变，则确定所述接受者将处于同种异体移植物排斥反应风险。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述改变包括所述样本中的基因标志集中的一种以上的基因的表达水平与所述对照中的基因标志集中的相同的一种以上的基因相比增加或减少。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述改变包括所述样本中的基因标志集中的一种以上的基因的表达水平与所述对照中的基因标志集中的相同的一种以上的基因相比增加和减少。

4.根据权利要求1、2或3中任一项所述的方法，其中所述基因标志集选自由以下组成的组：GZMH、ADGRG1、S1PR5、FGFBP2、NKG7、PRF1、KIAA1671、LAG3、TARP、FCRL6、FASLG、TBX21、TOX、ZNF831、CD8A、C1orf21、CCR5、LDOC1L、CCDC102A、HOPX、PRKCH、SLC25A34和F12。

5.根据权利要求1至3或4中任一项所述的方法，其中所述确定步骤包括将在患者的样品中确定的表达水平应用于加权累积风险评分r＝-(log₁₀(p₁)*g₁+log₁₀(p₂)*g₂+…+log₁₀(p_i)*g_i+...+log₁₀(p₂₃)*g₂₃)，其中p_i是训练集中EAR组与非EAR组之间对于基因i(i＝1…23)的表达值的t检验的显著性p值，g_i是基因i(i＝1…23)的逻辑数：1(如果基因i的表达值大于针对上调基因的训练集的EAR组的中值表达值，或者如果基因i的表达值小于针对下调基因的训练集的EAR组的中值表达值)、或-1(如果基因i的表达值小于针对上调基因的训练集的非EAR组的中值，或者如果基因i的表达值大于针对下调基因的训练集的非EAR组的中值)、或0(如果基因i的表达值介于训练集的EAR组的中值和非EAR组的中值之间)，可用作每个患者的急性排斥反应的风险评分。

6.根据权利要求1至4或5中任一项所述的方法，其中所述表达水平通过选自由以下组成的组的方法确定：Nanostring、TREx和定量聚合酶链反应(qPCR)。

7.一种用于在移植前鉴定处于同种异体移植物急性排斥反应风险的肾脏同种异体移植物接受者的方法，所述方法包括以下步骤：

(a)从所述肾脏同种异体移植物接受者中获得血液样本；

(b)从所述血液样本中分离mRNA；

(c)从所述mRNA合成cDNA；

(d)确定所述接受者血液中的基因标志集的表达水平；

(e)如果所述同种异体移植物接受者的血液样本中的基因标志集中的一种以上的基因的表达水平与对照血液样本中的相同的一种以上的基因的表达水平相比发生改变，则将所述同种异体移植物接受者诊断为处于急性排斥反应和同种异体移植物丧失风险，并用诱导疗法治疗鉴定为处于急性排斥反应或同种异体移植物丧失风险的接受者。

8.根据权利要求7所述的方法，其中所述诱导疗法包括施用治疗有效量的抗胸腺细胞球蛋白或坎帕斯-1H。