[发明专利]用工程化细菌泛素连接酶模拟物进行的广谱蛋白质组编辑

权利要求书

1.一种分离的嵌合分子，包含：

降解结构域，所述降解结构域包含E3泛素连接酶(E3)基序；

能够特异性地将所述降解结构域引导至底物的靶向结构域，其中所述靶向结构域与所述降解结构域异源；以及

将所述降解结构域与所述靶向结构域偶联的接头。

2.根据权利要求1所述的嵌合分子，其中所述E3基序包含修饰的结合区，与没有所述修饰的结合区的所述E3基序相比，其抑制或减少与所述底物的结合。

3.根据权利要求2所述的嵌合分子，其中所述修饰是在所述结合区中的突变或缺失。

4.根据权利要求1所述的嵌合分子，其中所述E3基序允许所述底物的蛋白水解。

5.根据权利要求1所述的嵌合分子，其中所述E3基序具有细胞类型特异性或组织特异性连接酶功能。

6.根据权利要求5所述的嵌合分子，其中所述连接酶功能是细胞类型特异性，并且所述细胞类型选自由以下组成的群组：皮肤细胞、肌肉细胞、上皮细胞、内皮细胞、干细胞、脐带血管细胞、角膜细胞、心肌细胞、主动脉细胞、角膜上皮细胞、体细胞、成纤维细胞、角质形成细胞、黑素细胞、脂肪细胞、骨细胞、成骨细胞、气道细胞、微血管细胞、乳腺细胞、血管细胞、软骨细胞、胎盘细胞、肝细胞、神经胶质细胞、表皮细胞、角膜缘干细胞、牙周干细胞、骨髓基质细胞、杂交瘤细胞、肾细胞、胰岛、关节软骨细胞、成神经细胞、淋巴细胞和红细胞。

7.根据权利要求1所述的嵌合分子，其中所述降解结构域来自细菌病原体。

8.根据权利要求7所述的嵌合分子，其中所述细菌病原体选自由以下组成的群组：志贺氏菌属(Shigella)、沙门氏菌属(Salmonella)、芽孢杆菌属(Bacillus)、巴尔通氏体属(Bartonella)、博代氏杆菌属(Bordetella)、疏螺旋体属(Borrelia)、布鲁氏菌属(Brucella)、弯曲杆菌属(Campylobacter)、衣原体属(Chlamydia)和嗜衣体属(Chlamydophila)、梭菌属(Clostridium)、棒状杆菌属(Corynebacterium)、肠球菌属(Enterococcus)、埃希氏菌属(Escherichia)、弗朗西斯氏菌属(Francisella)、嗜血杆菌属(Haemophilus)、螺杆菌属(Helicobacter)、军团菌属(Legionella)、钩端螺旋体属(Leptospira)、李斯特菌属(Listeria)、分枝杆菌属(Mycobacterium)、支原体(Mycoplasma)、奈瑟菌属(Neisseria)、假单胞菌属(Pseudomonas)、立克次体(Rickettsia)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、链球菌属(Streptococcus)、密螺旋体属(Treponema)、脲原体属(Ureaplasma)、弧菌属(Vibrio)和耶尔森菌属(Yersinia)。

9.根据权利要求7所述的嵌合分子，其中所述降解结构域来自细菌病原体，并且包含弗氏志贺氏菌E3连接酶、SspH1、SspH2、SlrP、AvrPtoB、LubX、NleG5-1、NleG2-3、LegU1、LegAU13、NIeL、SopA、SidC、XopL、GobX、VirF、GALA、AnkB或SidE。

10.根据权利要求1所述的嵌合分子，其中所述降解结构域是志贺氏菌属IpaH蛋白。

11.根据权利要求10所述的嵌合分子，其中所述志贺氏菌属IpaH蛋白选自由IpaH9.8、IpaH1.4、IpaH2.5、IpaH4.5、IpaH7.8、IpaH0887、IpaH1389、IpaH2022、IpaH2202、IpaH2610和IpaH0722组成的群组。