[发明专利]治疗和预防微生物感染

权利要求书

1.用于治疗受试者的急性微生物感染的方法中的可编程核酸酶，其中所述微生物感染由第一物种或菌株的微生物引起，且所述核酸酶可编程以切割由已经感染所述受试者的微生物的基因组包含的靶标位点，由此杀死所述第一物种或菌株的微生物，或减少所述微生物的生长或增殖，所述治疗方法包括将所述受试者暴露于所述核酸酶，其中所述核酸酶被编程以切割所述靶标位点，由此切割由所述受试者包含的微生物的基因组，且治疗所述受试者的急性微生物感染，其中所述方法包括到所述治疗的前30分钟将所述感染减少至少100倍。

2.用于持久地治疗受试者的微生物感染的方法中的可编程核酸酶，其中所述微生物感染由第一物种或菌株的微生物引起，且所述核酸酶可编程以切割由已经感染所述受试者的微生物的基因组包含的靶标位点，由此持久地杀死所述第一物种或菌株的微生物，或减少所述微生物的生长或增殖，所述治疗方法包括将所述受试者暴露于所述核酸酶，其中所述核酸酶被编程以切割所述靶标位点，由此切割由所述受试者包含的微生物的基因组，且持久地治疗所述受试者的微生物感染。

3.权利要求2的核酸酶，其中在第一时间(T1)和在第二时间(T2)向所述受试者施用所述核酸酶和/或对所述核酸酶进行编程以识别和切割所述靶标位点的核酸，其中T2是T1之后至少1小时。

4.权利要求2或3的核酸酶，其中所述方法包括到所述治疗的前30分钟将所述感染减少至少100倍。

5.任一前述权利要求的核酸酶，其中所述方法包括在将所述受试者暴露于编程的核酸酶后，使所述感染减少至少100倍维持至少60分钟。

6.任一前述权利要求的核酸酶，其中所述方法包括减少所述感染，使得在所述治疗的前30分钟后，感染的减少立即持续30分钟。

7.任一前述权利要求的核酸酶，其中所述方法包括向所述受试者施用RNA或编码RNA用于在所述受试者中表达所述RNA的核酸，其中所述RNA与所述核酸酶复合以对所述核酸酶进行编程以切割由所述受试者包含的微生物中的靶标位点。

8.权利要求7的核酸酶，其中

a. 将所述核酸酶与所述RNA或核酸同时或依次施用于所述受试者；或

b. 在向所述受试者施用所述RNA或核酸之前，所述受试者包含所述核酸酶。

9.权利要求7或8的核酸酶，其中将多种病毒施用于所述受试者，其中每种病毒包含所述核酸的拷贝，其中所述病毒感染由所述受试者包含的微生物以向其递送所述核酸。

10.权利要求9的核酸酶，其中施用的病毒：由所述受试者包含的微生物的比率为10至150。

11.根据任一前述权利要求所述的核酸酶，其中所述受试者是人或动物，且其中所述感染是肺部、腹部或尿路的感染；或其中所述受试者已经经历手术，正进行免疫抑制剂药物治疗或正患有慢性疾病。

12.根据任一前述权利要求所述的核酸酶，其中所述方法用于治疗所述受试者中由第一物种或菌株的细菌(第一细菌)引起的致病性细菌感染的方法中，所述方法包括通过切割由所述第一细菌的基因组包含的靶标位点来选择性杀死由所述受试者包含的第一细菌，其中所述切割使用所述可编程核酸酶实施，所述可编程核酸酶被编程以切割所述靶标位点，其中所述受试者正患有除了所述致病性细菌感染以外的另外的疾病或病况，且所述方法包括将疗法施用于所述受试者用于治疗或预防所述另外的疾病或病况，其中所述核酸酶治疗所述感染，且在编程的核酸酶存在的情况下，所述疗法对于治疗或预防所述疾病或病况是有效的。

13.权利要求12的核酸酶，其中(i)所述受试者是癌症患者，且所述疗法包括施用造血干细胞移植物、化学治疗剂、免疫检查点抑制剂、免疫检查点激动剂或免疫细胞增强剂；过继性细胞疗法；放射或手术；或(ii)所述疗法是组织、器官或细胞移植。